主要的農業會計科目有：營業收入科目、營業支出科目、投資收益科目、投資支出科目、財務費用科目、稅務科目、存貨科目和固定資產科目。
以農場會計為例，它的主要賬戶科目可以分為六個部分：壹、資產；二、負債；三、所有者權益；四、收入；五、成本費用；六、稅金。
其中，資產科目有流動資產、非流動資產，其中流動資產科目主要包括：現金、存貨、應收款項等；非流動資產科目包括：固定資產、在建工程、無形資產、其他非流動資產等。負債科目有：流動負債和非流動負債，流動負債科目主要包括：應付賬款、應付職工薪酬、應交稅費、其他流動負債等；非流動負債科目包括：長期借款、應付債券等。所有者權益科目主要是股東權益、未分配利潤等。收入科目包括銷售收入、其他業務收入等；成本費用科目包括：原材料成本、生產成本、經營費用、稅費等；稅金科目則包括：應交稅費等等。