醫院會計科目的內容主要：
資產類：反映醫院全部資產狀況的總賬科目，按資金的流動性強弱，分為現金、銀行存款、其他貨幣資金、應收票據、應收在院病人醫藥費、醫療應收款、其他應收款、壞賬準備、庫存物資、在加工材料、長期投資、固定資產、累計折舊、固定資產清理、在建工程、無形資產、待處理財產損益等科目。
負債類：反映醫院全部負債狀況的總賬科目，按不同的債權人和債務類型，分為醫療預收款、應付票據、應付賬款、其他應付款、應付工資、應付福利費、應付社會保障金、應交藥品收入、預提費用、長期應付款等科目。
基金類：反映醫院全部基金狀況的總賬科目，按基金的用途，分為事業基金、專項基金、待沖基金、收付結余、結余分配等科目。
收支類：反映醫院全部收入和費用支出狀況的總賬科目，按收入的來源和支出和去向，分為醫療收入、醫療業務成本、其他收入、其他支出、財政補助收入、財政補助支出、科教項目收入、科教項目支出、管理費用、投資收益等科目。