審計部的職責是經濟監管(通過日常監管保證公司財務的良好運行)；經濟核實(審計部門和審計人員檢查和核實公司的會計報表和其他相關經濟數據)；經濟評價(評價財務部門的工作，肯定其成績，找出其工作中存在的問題)。
審計部主要負責經營管理的合規性審計，監督合規管理體系的運行。其主要職能是檢查公司合規管理的執行情況，評價合規管理體系的健全性和有效性，並提出整改建議。審計部門與合規部門的關系包括:
1.合規部和審計部相對獨立，合規部接受審計部的獨立檢查。
2.審計部負責公司經營活動的合規性檢查。
3.合規部為審計部門的合規檢查提供方向和重點。合規部門可以要求審計部門對合規風險的具體領域進行審查，審計部門應當將其作為年度內部審計的壹部分。
4.審計部門的合規檢查結果是合規部門識別和收集合規風險信息和合規風險點的重要來源和依據。檢查結束後，審計部門應將相關合規檢查信息和結論抄送合規部門，為合規部門識別和收集合規風險信息和合規風險點提供有效的信息來源和依據。合規部可以看作是公司內部的非現場監管部門，而審計部壹直負責審計工作，相當於公司內部的現場檢查部門。其工作具有“事後”的特點，公司內部所有的組成部分，包括合規部門，都需要接受審計部門的監督，定期獨立檢查。