1、加強會計工作管理
各級財政部門、業務主管部門要認真履行《會計法》賦予的職責，采取切實措施，指導和督促各基層單位加強會計基礎工作，整頓會計基礎工作中不規範的做法和存在的嚴重問題，不斷提高會計基礎工作水平，定期組織會計基礎工作情況的檢查。財政部門或者業務主管部門可以組織檢查組進行抽查或普遍檢查或重點檢查，對檢查中發現的問題，要提出整改意見，並檢查整改意見的落實情況。
2、建立健全內部會計管理制度
企業要建立健全內部會計制度，明確會計人員的職責和權限，建立完善的崗位責任制、內部牽制制度和稽核制度。會計監督要由事後監督轉向全方位、全過程的監督。從單位的內部會計監督到上級主管部門監督，再到財政、審計部門以及社會等的監督，為確保會計信息質量，加強會計工作的管理和監督。
3、嚴格做好憑證的審核和管理，規範會計賬簿的設置和登記
對於憑證審核和管理，第壹，要嚴格做好原始憑證的填制和審核工作。第二，要強化記賬憑證的填制和管理。
4、加強會計職業道德建設
首先，加強會計人員的業務素質?企業要嚴格按照《會計從業資格管理辦法》的有關規定，認真做好會計專業技術資格考試和考核工作。其次，加強會計人員職業道德建設。真正做到愛崗敬業、熟悉法規、依法辦事、客觀公正、搞好服務、保守秘密。最後，要加強對會計人員的法制教育，正確樹立依法辦事的觀念。
5、構建財務信息溝通平臺
面對會計核算信息溝通較弱的狀況，應構建財務信息溝通的平臺，建立預算指標控制系統，並且定期向核算單位出具會計核算財務報告，實現核算中心與各部門之間信息及時溝通，避免業務脫節。
6、嚴格按照資金支付程序
對於現實支付業務實行銀行和財政資金支付系統的***同資金審核程序，經過系統確認審核準確的情況下，才可以支付資金，為防止偽造支票、印鑒，到銀行套取現金情況的發生，在開具支票、簽章、付款分屬窗口會計、中心總出納、銀行的前提下，建立財政資金支付系統，實現資金審核“雙保險”，通過系統認證、審核，確定無誤後，方可支付資金，從而盡可能降低中心在支付資金環節上的風險。
7、完善支付審核評價體系
建立完善的支付審核評價體系，審核經費開支的合理性，會計核算中涉及的內容業務無法都使用統壹的支付標準，可以根據具體問題實行二級審核機制，在合理合規的範圍內，可以按照規定的執行，沒有相關規定的，窗口會計無法確定費用類別的可以報至綜合業務科室領導進行審核。
8、加大內部審計的力度
會計核算中心內部控制環境的優劣影響著其他控制業務的開展和實施的效果。提高對內部控制環境的重視，建立有效的監控機制，同時加大對內部審計制度的規範管理，由主要領導責任人成立專門的內部考核小組，審核會計核算中心業務人員的工作能力與業務水平，定期抽查窗口業務會計處理的核算單位的賬務情況，通過內審及時發現內部控制中出現的問題。
9、實行開支權限控制制度
加強對核算工作人員的業務水平的監管，實行開支權限控制，依據支出管理信息對相關業務會計進行權限的限定經費的支付按照開支權限支付流程，以保證財政資金的安全支付。同時加強對核算中心人員的業務能力和職業道德教育，避免因工作人員粗心或判斷錯誤，甚至越權越職等行為影響內部控制業務的正確性，宣傳相關的法律法規，開展職業道德素質培訓，提高會計核算人員的職業素質和技術水平。