1、收到撥款
借：銀行存款
貸：專項應付款
2、采購材料
借：原材料
/
庫存商品
貸：庫存現金
/
銀行存款
等
3、領用材料
借：在建工程
貸：原材料
/
庫存商品
4、發生的人工費用
借：在建工程
貸：應付職工薪酬
5、發生的其他費用（不符合資本化條件的）
借：管理費用
貸：庫存現金
/
銀行存款
6、項目驗收後結轉固定資產
借：固定資產
貸：在建工程
7、如果剩余資金需要上交的
借：專項應付款
貸：銀行存款
8、如果允許用剩余款沖抵費用的
借：專項應付款
貸：管理費用
（或紅字借方）
9、最後，專項應付款賬戶貸方余額結轉資本公積
借：專項應付款
貸：資本公積
結轉後“專項應付款”科目沒有余額。
專項資金支出時怎麽做會計分錄？
借：銀行存款
貸：專項應付款 —— 項目
專項資金支出即專項支出，專項資金有三個特點：壹是來源於財政或上級單位；二是用於特定事項；三是需要單獨核算。專項資金按其形成來源主要可分為專用基金、專用撥款和專項借款三類。
為了核算各種專項資金的實際支出數，事業單位應該設置“專款支出”賬戶。該賬戶屬於支出類賬戶，借方登記單位指定的項目或用途實際開支的料、工等費用，貸方登記專款資金支出收回數。
平時，借方余額反映專款支出的累計數。該賬戶應按專款的項目設置明細賬進行明細核算。
事業單位按指定的項目或用途開支工料費，借記“專款支出”科目，貸記“銀行存款”、“材料”等科目；
項目完成，向有關部門單獨列報時，借記“撥人專款”科目，貸記“專款支出”科目。
專項資金按照下列原則管理和使用：
（壹）統籌規劃。省級財政部門應當會同有關部門和單位，結合本省（自治區、直轄市、計劃單列市、新疆生產建設兵團，下同）經濟社會發展規劃、科技發展實際需求和現有科技資源布局，編制本省科技基礎條件建設五年規劃，並在規劃內確定分年度支持重點。
（二）突出重點。專項資金應當集中財力辦大事，重點支持能夠提升本地區、單位科技創新能力或科學普及水平的項目。
（三）傾斜扶持。專項資金對中西部地區給予適當傾斜扶持。
（四）專款專用。專項資金應當按照規定用途專款專用，不得用於本辦法規定範圍以外的項目，不得抵頂單位行政、事業經費。各級科技、財政部門和有關單位不得截留、挪用和擠占。