選項A錯誤，會計檔案鑒定工作應由單位檔案管理機構牽頭，組織單位會計、審計、紀檢監察等機構或人員***同進行；
選項B錯誤，單位檔案管理機構(而非會計管理機構)負責組織銷毀工作，並與會計管理機構***同派員監銷；
選項C正確，保管期滿但未結清的債權債務會計憑證和涉及其他未了事項的會計憑證不得銷毀，紙質會計檔案應當單獨抽出立卷，電子會計檔案單獨轉存，保管到未了事項完結時為止；
選項D錯誤，單位檔案管理機構編制會計檔案銷毀清冊。故選C。