（壹）辦公室（人事科、監察室）
綜合協調和督查局機關日常政務；建立健全局機關各項規章制度；負責局機關重要會議的組織和文電、信息、機要、保密、政務公開、檔案、信訪、宣傳、安全保衛、對外聯絡等工作；負責起草綜合性文稿；負責規範性文件合法性審查、報備、清理；組織辦理人大代表建議和政協委員提案；負責局機關及局屬單位機構編制、組織人事、退休人員服務管理以及黨群等工作，實施年度工作目標責任制及考評；承辦局系統紀檢監察、反腐倡廉、效能建設和糾風工作；查處違反黨紀政紀案件；配合有關部門對黨員進行黨風黨紀教育，對監督對象進行廉潔自律教育；負責督導全系統的衛生信息化、行風建設工作；負責下屬醫療單位領導班子的選拔、培養、考察、配備工作；擬定並組織實施全區衛生人才發展規劃，合理配置衛生人才資源。
（二）計劃財務科
負責提出全區衛生事業發展規劃和財務工作計劃；負責區級衛生經費的安排、使用和管理工作；負責全區衛生財務管理工作，參與制訂全區衛生經濟政策和系統財務規章制度；負責全區醫療服務收費價格和藥品價格的管理工作；負責全區衛生統計工作；負責區級衛生基建項目管理，對鎮鄉（街道）衛生建設項目給予指導；負責局機關會計核算、財務管理、總務後勤工作；負責全區衛生財政轉移資金的使用與管理工作；負責有關公***衛生單位和社團組織的財務核算；負責系統政府采購管理；負責醫療衛生單位法人代表經濟責任審計及其他審計。
（三）醫政科教科
負責轄區內醫療機構(包括社會醫療機構和個體醫療機構)的行業管理工作；監督管理醫療機構的醫療質量和服務質量；負責醫療糾紛處置管理工作；研究和擬訂社區衛生、農村衛生服務的發展規劃、技術標準、管理辦法，並予以組織實施和指導監督；依法管理全區中醫藥（含中西醫結合）工作，擬訂並組織實施中醫藥發展規劃；負責婦幼衛生保健工作；負責醫療機構、醫師、護士、鄉村醫生、醫療技術和醫療設備等醫療服務要素的準入管理；兼管區醫學會、中醫學會的工作；組織醫療救護、征兵(招生)健康體檢和臨床用血管理工作；組織實施重點疾病預防、殘疾人“三項”康復等工作；制定、落實專業人才培養和職工在職培訓、進修計劃；組織衛生行業專業技術職務資格考評；負責全區醫學科技計劃、重點學科建設、科技信息、科技成果與推廣的管理工作；負責全區城鄉醫院對口支援和衛生適宜技術推廣工作；負責國家基本藥物制度的貫徹落實；負責藥械、壹次性耗材集中采購及日常監管工作。
（四）疾病控制與衛生監督科
組織實施面向社會的傳染病防治、公***場所、飲用水、職業、環境、放射、學校衛生、非法行醫等綜合衛生監督執法；提出全區疾病預防控制規劃及措施並組織實施，指導全區衛生監督執法和疾病控制工作；負責對達到聽證額度及社會敏感性較強的行政處罰案件初審；組織制定有關突發公***衛生事件應急預案、工作方案和措施；依法落實重大突發公***衛生事件應急處置措施，依法履行疫情通報、報告或者公布職責；負責兒童計劃免疫工作的組織和檢查考核；負責組織對各鎮鄉（街道）公***衛生工作考核及工作落實情況督查，協同有關部門做好計劃生育工作。
（五）行政許可科
制定衛生行政許可事項的實施辦法及具體操作流程；負責全區各類醫療機構的設置審批（100張床位以下）、執業登記、變更、註銷及年度校驗工作；負責全區執業（助理）醫師、執業護士、鄉村醫生的註冊（包括變更註冊、再註冊、註銷等）工作；負責全區母嬰保健機構的審批、母嬰保健技術人員的發證工作；負責食品衛生、公***場所衛生許可發證工作；負責放射診療許可、供水單位衛生許可發證工作；負責醫療廣告初審、麻醉藥品與第壹類精神藥品購用印鑒卡核發工作；負責建設項目職業病危害預測評價報告的審查。
（六）衛生保健科
負責全民保健工作的具體管理和組織協調，指導全民保健基地醫院的保健工作；研究制定全民保健工作規則和相關制度，負責保健對象重大病情的會診、治療、搶救等醫療保健組織管理工作；負責來訪的重點保健對象來我區期間的醫療保健工作；負責在本區舉辦的重要會議、大型活動重點保健對象的醫療保健工作；負責保健對象健康體檢、健康教育等預防保健工作。
區愛國衛生運動委員會辦公室
提出愛國衛生運動規劃；組織、協調區愛衛會成員單位開展工作；研究和擬訂初級衛生保健的發展規劃；組織、指導全區創建衛生城市、衛生單位、農村改水改廁、城鄉除“四害”及健康教育工作；承擔區愛國衛生運動委員會的其他日常工作。