內部控制系統需要改進。雖然內部控制規範的適用範圍包括行政事業單位，但主要是在企業中實施，而關於行政事業單位內部會計控制沒有詳細的說明，對行政事業單位控制的理論研究也很少。
二是行政事業單位內部控制存在的問題。
1，缺乏內部控制意識，內部控制制度弱化，缺乏建立內部會計控制的積極性和主動性；
2.會計基礎工作比較薄弱，會計人員綜合素質不高。有的單位會計人員壹崗多職，崗位沒有起到相互制約、相互監督的作用；
3.監督考核機制不到位，內部審計機構大多與會計部門平行，附屬於執行機構，權威性和獨立性不夠；
4.忽視與內部會計控制制度和考核掛鉤的監督機制，形成重考核輕內部會計控制的現象；
5.內部控制環境受其上級部門的影響很大。