1.要求報考條件不壹樣：會計碩士應屆生就可以考，不需要工作經驗，工商管理碩士，即MBA需要有工作經驗；
2.培養目標不壹樣：會計碩士培養德、智、體全面發展，適應我國社會主義市場經濟發展和經濟全球化背景下從事會計職業所需的職業道德和專業知識與技能的應用型高級專門人才。工商管理碩士培養能夠勝任工商企業和經濟管理部門高層管理工作需要的務實型、復合型和應用型高層次管理人才；
3.工作對象不壹樣：會計對象是指會計核算和監督的內容，具體是指社會再生產過程中能以貨幣表現的經濟活動，即資金運動或價值運動。工商管理學的對象是研究盈利性組織經營活動規律以及企業管理的理論、方法與技術的科學。