1，不同用途:
內部審計評價內部控制的有效性和財務信息的真實性和完整性；附註審計審計被審計單位財務報表的合法性和公允性。
2.不同的獨立性:
內部審計服務於內部組織，接受總經理或董事會的領導，獨立性較弱。註冊會計師審計為需要可靠信息的第三方提供服務，獨立於被審計單位管理層的領導和制約。
第二，聯系
政府審計、內部審計、註冊會計師審計都是審計工作，構成審計監督體系，不可替代。三種審核的結果對內部審核工作具有指導意義，外部審核可以使用內部審核的結果。政府審計和註冊會計師審計之間的審計結果也可以相互參考，提高工作效率。
獨立審計標準
獨立審計準則體系由獨立審計基本準則、獨立審計具體準則、獨立審計實務公告和職業規範指南三個層次組成。獨立審計準則是社會審計職業標準體系的重要組成部分，是註冊會計師依法獨立執行審計業務、出具審計報告和發表審計意見的職業標準和技術規範。獨立審計準則的性質取決於機構和發布機關的法律地位，體現了獨立審計準則的權威性和約束力。
以上內容參考:百度百科-社會審計