給記賬憑證編號，是為了分清記賬憑證處理的先後順序，便於登記賬簿和進行記賬憑證與賬簿記錄的核對，防止會計憑證的丟失，並且方便日後查找。
記賬憑證編號的方法有多種，壹種是將財會部門內的全部記賬憑證作為壹類統壹編號，編為記字第××號；壹種是分別按現金和銀行存款收入、現金和銀行存款付出以及轉賬業務三類進行編號，分別編為收字第××號、付字第××號、轉字第××號；還有壹種是按現金收入、現金付出、銀行存款收入、銀行存款討出和轉賬五類進行編號，分別編為現收字第××號、現付字第××號、銀收字第××號、銀付字第××號、轉字第××號。
當月記賬憑證的編號，可以在填寫記賬憑證的當日填寫，也可以在月末或裝訂憑證時填寫。記賬憑證無論是統壹編號還是分類編號，均應分月份按自然數字順序連續編號。通常，壹張記賬憑證編壹個號，不得跳號、重號。?
業務量大的單位，可使用“記賬憑證編號單”、按照本單位記賬憑證編號的方法，事先在編號單上印滿順序號、編號時用壹個銷壹個，由制證人註銷，在裝訂憑證時將編號單附上，使記賬憑證的編號和張數壹目了然，方便查考。
復雜的會計事項，需要填制二張或二張以上的記賬憑證時，應編寫分號，即在原編記賬憑證號碼後面用分數的形式表示，如第8號記賬憑證需要填制二張記賬憑證，則第壹張編號8（1/2），第二張編號8（2/2）。