現行《高等學校會計制度》中規定借入款項是指單位從財政部門、上級單位、金融機構和其他單位借人有償使用的各項款項。許多高校的資金來源中，借入款項占了相當大的比重。
（壹）借入款項的借入和歸還事業單位借入款項的賬務處理應為：借記“銀行存款”，貸記“借入款項——某單位”；待該筆負債清還時再做減少負債的處理；經批準借款轉撥款的，借記“借入款項”，貸記“科研經費撥款”、“上級補助收入”等。在政府收支分類改革以前，支付借款利息在“其他費用”中反映；在歸還借款本金時將往來帳中的“借入款”科目減少。在政府收支分類改革以後，雖然有專門的“債務利息支出”和“債務還本支出”兩個科目，但也只有支付借款利息在“債務利息支出”科目中反映。在年初預算中都安排了壹部份資金用於還本付息，這壹部分資金財政按專項下達的，要求必須專款專用，但在支出科目中根本沒有體現，在預算中安排的還本資金就只能彌補當年其他的事業支出，如果當年有結余，可以把暫付款中暫列的支出調整壹部分出來，以保證年終決算中收入與支出的平衡。
高校收支科目中只核算了財政補助收入和單位事業收入所對應的收支款項，而同樣作為高校資金來源的借入款項和其所對應的支出情況並未在當年的會計報表中反映出來，這就造成了會計核算的失真，同時也造成了每年收入和支出的不相匹配。筆者認為，對於“借入款項”的核算，應當視款項的性質區別處理：首先對於短期借款，比如在壹年內歸還的借款，應該在“借入款項”中反映，因為該借款在年終時需要用事業收入來歸還，不會對當年的收支產生影響；其次對於長期借款，筆者建議將其記入“其他收入”中，而其所對應發生的支出項目也直接在相關支出科目中進行核算，在歸還長期借款的時候直接在“債務還本支出”科目中反映，以全面反映財務收支情況，方便學院的財務管理和財務分析。
（二）借入款對固定資產的影響絕大多數高校的借人款項屬於專項借款，少部分為流動資金貸款，而大多數借入款項都是用於設備物資的購置和固定資產的構造。按照事業單位的有關財物會計制度規定，年度終了必須保持財物收支的平衡，但是外部借入的款項不能計入高校當年的收入，入賬時只能在往來賬中反映，所以當借入款項被用於購置固定資產時，高校直接在“事業支出”科目中反映。而筆者認為，在支出款項發生時直接在其他應收款中進行核算，其會計分錄應為：借記“其他應收款——借款支出”，貸記“銀行存款”；年終時，如果學校有收入來歸還借款時，則借記“事業支出”，貸記“其他應收款——借款支出”。
在以上的處理方法下，只有學校有足夠的收入來歸還借款，才能真實的反映出當年的收入和支出情況；如果學校沒能歸還借款，用於固定資產購置的支出就只能壹直在往來款項中反映，而固定資產的帳面余額就不能與購置費等支出科目中的帳面余額相對應，也會出現固定資產的維持、維護費用的發生，而在支出科目中根本找不到對應的固定資產購置業務。在當年實際發生的支出項目而不能在當年的決算報表和支出科目中體現出來，導致了會計帳表實用性的降低。
（三）借入款對會計報表的影響在決算報表中，雖然借入款項的余額在資產負債表中有所反映，但是決算報表中所反映出來的支出數已經是調整以後的數據，並不是當年實際的支出數。因為在年終決算時，不允許負基金的出現，所以如果收不抵支就必須把借入款在事業支出中的反映調整到“其他應收款”中去，這就減少了當年的實際支出；而在有事業結余的情況下，學校壹般都會將原來年度調整到“其他應收款”中的支出調整壹部份出來，以實現當年收支的基本平衡，這也就虛增了當年的支出。
筆者認為，高校將需要歸還的借款用於購置資產時，應在支出事項發生時全部計人事業支出，對於出現的負基金，年底編制財物決算報表時，另設壹補充報表，補充說明借入款項收支的詳細情況；另壹種做法就是將借入款項轉入“其他收入”中進行核算，支出事項發生時也全部計人事業支出，使年終時收入與支出相匹配。
二、借入款項的管理
據中國社會科學院發布的《2006年：中國社會形勢分析與預測》顯示，截至2005年，我國公辦高校向銀行貸款總額達1500億~2000億元，幾乎所有的高校都有貸款。加強對借入款項的管理勢在必行。 考試大助妳成功
（壹）建立健全監督管理體系政府和教育主管部門應加大對高校借入款項的事前、事中和事後管理工作。首先在借入款項前期嚴格執行可行性研究和層層審批制度，確保在源頭上規範高校的借款行為，確保高校貸款的可行性和安全性；其次還應該在借入款項的使用過程中加大監督管理工作，確保做到專款專用，避免借入款項被挪作他用；再次就是要加強後期還款的促進作用，積極督促高校按合同、按計劃歸還款項，建立良好的信用體制。
（二）加大對借入款項管理的重視力度教育部門對借入款項進行整體風險評估，避免出現壹任校長貸款、幾任校長都還不清的局面，適度控制借入款項的規模，使借入款項為學校發展服務。學校應當建立、健全還貸機制，將貸款管理納入預算管理體制。在安排年度收支預算時，要結合本校的償債能力，將還貸資金納入年度收支預算，促使學校科學、有效的使用借款，促進學校進入良性發展循環。還有就是有條件的學校可以建立還貸基金，每年從結余的資金中拿出壹部分放在基金中，避免還款高峰的到來對學校財物造成的風險。