會計學
會計學專業主要研究會計的理論與方法，解決在我國經濟建設工作中圍繞資金運動所產生的壹系列問題。該專業培養具有良好道德品質、敬業精神，能夠創造性的學習和運用會計學以及其他相關學科知識與技能，熟練掌握會計軟件操作，具有壹定的會計軟件設計水平，較強的外語聽說能力，專業基礎紮實，處理問題靈活，綜合素質優異，能在會計、財務領域從事會計組織管理、會計業務核算、會計制度設計、審計以及在科學研究和教學工作中能發揮出色作用的高素質應用型人才。
主要專業課程：初級財務會計、中級財務會計、成本會計、財務管理、管理會計、高級財務會計、電算化會計、審計學、會計理論專題。
註冊會計師方向
註冊會計師專業方向是經教育部、財政部等部委批準，從1994年開始在全國22所高校中試辦的本科專業方向。財政部每年撥專款資助各校註冊會計師專業方向建設，其宗旨是培養註冊會計師行業高質量的後備人才。註冊會計師方向要求學生掌握註冊會計師審計理論與方法，以及創造性運用這些理論方法所必備的自然科學、哲學社會科學中有關的知識，並應具備註冊會計師審計業務、基本會計業務的處理能力；具有較強的語言和文字表達、人際溝通、組織協調和信息獲取能力；培養具有良好道德品質和敬業精神，能夠創造性運用會計學以及其他相關學科知識與技能，在註冊會計師行業以及會計財務領域從事業務管理與核算的高級專門人才。
吉林財經大學會計學院自1995年開始招收CPA專業方向本科生，至2013年已累計畢業906人。經過十五年的建設， CPA專業方向已成為吉林省最有影響力的品牌專業之壹。從2005年起，從2005年起，國家對註冊會計師專業方向在校三年級學生啟動了境外實習項目，為學生了解境外註冊會計師行業的執業環境、專業技術和管理手段提供了難得的機遇。通過筆試、面試，會計學院至2014年已有超過100名大學三年級在校學生獲得赴境外國際四大會計事務所實習的機會。在2012和2013年度CPA專業方向教學質量評估中，在全國22所CPA專業方向院校中連續排名第壹位。
2012年9月22-23日，中註協組織開展第八屆註冊會計師專業方向院校學生境外實習選拔及簽約工作。在全國16所註冊會計師專業方向院校中，會計學院***有14名同學從104名學生中脫穎而出。會計學院在本次校內***選拔中***有15名同學參與北京選拔考試，本次以英語面試為主要考核形式，每場有九名考官對考生進行考核測評。14名同學在最後考核中成績突出，最後獲得了參與境外實習的機會。
該專業方向培養德、智、體、美全面發展，適應社會經濟發展的需要，掌握管理學、經濟學、法學的基礎知識，掌握會計基本理論，熟悉會計及審計業務，具有履行註冊會計師職責和承擔審計工作的能力，能在會計師事務所及其他審計組織從事審計及咨詢業務的高素質應用型人才。
註冊會計師專業方向每年設3個班，壹般在新生入學後或壹學年後選拔組建。其中1個班為國際會計實驗班，該實驗班註重對學生“聽、說、讀、寫”的訓練，加強對學生涉外會計知識與技能的培養，核心課程采用雙語授課。
主要專業課程：初級財務會計、中級財務會計、高級財務會計、成本會計、財務管理、管理會計、審計學、計算機審計、管理咨詢、稅法、經濟法等。
財務管理
該專業主要研究社會及企事業單位資金運動過程及其規律，解決各單位籌資、用資、管資，加速資金周轉，提高經濟效益問題。本專業培養具有良好道德品質、敬業精神，能夠創造性運用財務管理以及其他相關學科知識與技能，熟練掌握會計軟件操作，具有壹定的財務軟件設計水平，較強的外語聽說能力，專業基礎紮實，處理問題靈活，綜合素質優異，能在財務、會計領域從事財務活動管理、財務策劃、資產經營、業務核算以及科學研究和教學工作中發揮出色作用的應用型高素質專門人才。
主要專業課程：中級財務管理、財務案例、財務分析學、高級財務管理、國際財務管理、成本會計、管理會計、中級財務會計、金融工程。
審計學
該專業培養具有良好道德品質，適應社會經濟發展的需要，具備管理學、經濟學、法學和計算機應用知識，精通會計業務和審計業務；基礎紮實、知識廣博、富有發展潛力，能夠勝任審計專業工作的“應用型、復合型”高素質專門人才。學生畢業後，能在國家審計機關、單位內部的審計機構和社會審計組織從事審計、會計實務工作，以及在學校、研究單位從事審計教學和研究工作。
主要專業課程：審計學基礎、經濟法、稅法、財務管理、財務審計、經濟責任與經濟效益審計、固定資產投資審計、審計技術與方法、內部審計、中級財務會計、成本會計、高級財務會計、電算化會計等。 吉林財經大學1990年即獲得（學術型）會計碩士學位授予權。
會計碩士專業學位英文名稱為 Master of Professional Accounting ，簡稱 MPAcc，是和傳統學術型研究生相對的、國家今後將大力發展的應用型會計研究生。
培養目標、培養方式與學習年限
會計碩士(MPAcc)專業學位教育面向應屆畢業生和會計實務界，培養德智體全面發展，具備良好的職業道德和法紀觀念，系統掌握現代會計學、審計學、財務管理以及相關領域的知識和技能，對會計實務有充分的了解，具有很強的解決實際問題能力的高層次、高素質、應用型的會計專門人才。
培養方式為脫產全日制培養。采用學分制，學習年限為2-3年。每年學費預計8000-10000元。
招生對象及擬招收人數
國家承認學歷的應屆或往屆本科畢業生；國家承認學歷的高職高專畢業後工作滿2年或2年以上(從高職高專畢業到2011年9月1日)、達到與大學本科畢業生同等學力考生；國家承認學歷的本科結業生和成人應屆本科畢業生，按本科畢業同等學力身份報考；自考生和網絡教育學生須在報名現場確認截止日期前取得國家承認的大學本科畢業證書方可報考；在校研究生報考需在報名前征得所在培養單位同意。
學位授予
修滿規定課程學分並通過論文答辯者，授予由國務院學位委員會辦公室統壹印制的會計碩士專業學位（MPAcc）證書和學歷證書（即“雙證書”）。
考試內容
（壹）初試內容
（1）101：思想政治理論；（2）201：英語或203：日語；（3）399：管理類聯考綜合能力（4）443：會計學。
其中，思想政治理論、英語或日語、管理類聯考綜合能力三門課程的詳細內容請參見國家最新發布的相關考試大綱。
會計學課程考試的參考教材為：
① 《基礎會計》（第二版），陳國輝主編，東北財經大學出版社，2009年6月。
② 《財務管理學》（第四版）第三章“財務分析”，荊新等主編，中國人民大學出版社，2006年。
註冊會計師考試教材《財務成本管理》第二章“財務報表分析”，中國註冊會計師協會編，中國財政經濟出版社，2010年3月。
說明：以上兩本教材選擇壹本即可。
③ 《管理會計學》（第五版）第二、三、六、八章的相關內容，孫茂竹等主編，中國人民大學出版社。
（二）復試內容
財務會計、財務管理。
參考教材為：
①《中級財務會計》（第2版）劉永澤等，東北財經大學出版社，2009年。②《財務管理學》（第四版或第五版），荊新等主編，中國人民大學出版社，2006年或2009年。 會計學院師資隊伍力量雄厚，學術梯隊結構合理。會計系現有教授8人，副教授19人，高級職稱人數占全部教師總人數的45%以上；現有博士3人，在讀博士16人，具有碩士學位以上的教師占全部教師總人數的70%以上；現有校首席教授1人、主講教授2人、碩士研究生導師11人和壹大批中青年骨幹教師，45歲以下的中青年教師約占75%，具有較大的發展潛力。