高級財務管理與大數據碩士項目旨在適應大數據時代給財務人員帶來的機遇和挑戰，與資本市場學院合作，註重實用性，全面培養具有數據思維的高級財務管理人才，服務粵港澳大灣區的可持續發展。？
醫院管理碩士項目隸屬於清華大學醫院管理研究院，是國內首家專門從事醫院管理研究和現代醫院管理人才培養的跨學科機構。匯集國內外醫院管理領域的優質辦學資源，凝聚清華大學眾多專業學院和壹流學科的力量。
自2000年創辦以來，清華大學經濟管理學院和香港中文大學商學院共培養了2000多名掌握金融理論和管理專業知識並具有金融實踐經驗的畢業生。
清華科技創新MBA項目由清華大學經濟管理學院和清華大學深圳國際研究生院聯合培養。基於經管學院30多年MBA教育的先進經驗，依托清華大學壹流的教學團隊和強大的行業專家資源，采用管理理論體系學習與專業實踐相結合的培養模式，旨在培養具有數字金融理念、科學素養和創新精神的未來領導者。
創新領軍工程師粵港澳大灣區博士以服務粵港澳大灣區及周邊地區的國家重點產業和創新型企業為目標，培養創新高端領軍人才，服務粵港澳大灣區創新驅動發展戰略。招生專業學位類別包括電子信息、機械、材料與化工、資源與環境、能源與動力、民用水利和生物與醫學。