辦公室
協助辦公室領導組織協調機關日常工作；負責文秘、機要、保密、信訪、督查、信息、宣傳、檔案、接待、安保、辦公自動化、會議組織和綜合文稿起草工作；負責辦公室的財務工作；辦理有關出國經貿團組的審批；協調管理辦公室的服務中心、信息中心和海外辦事處。
人事教育辦公室
負責機關及直屬單位幹部隊伍建設、人事、教育培訓、勞動工資管理；負責駐外機構人員的選拔和管理，負責部門和直屬單位出國(境)人員的審核；組織和指導外經貿系統的業務培訓。
調查和管制司
研究制定全省外經貿發展的戰略和政策；調查研究外經貿發展中的重大問題，提出促進外經貿發展的建議；研究擬定全省外經貿體制改革方案；組織起草外經貿地方性法規、規章和制度；組織對外貿易法律法規的宣傳；負責行政復議和行政處罰的聽證；參與重大項目的談判和重要協議、合同的起草和審查；指導和協調外商投訴的處理工作；指導和協調全省出口商品反傾銷和反補貼案件的應訴工作。
規劃和財務辦公室
編制全省中長期對外經貿規劃，制定年度進出口控制目標，調整進出口商品結構規劃，協調和指導全省農副產品出口；指導全省外經貿系統的財務、會計和內部審計工作；負責管理外經貿基金和資金；機關及直屬單位國有資產管理辦公室；負責全省外經貿統計匯總和分析工作；指導國有外經貿企業改革。
對外經濟貿易發展和加工貿易司
組織實施國際市場多元化發展戰略；協調和管理全省進出口業務和加工貿易業務；審批省級管理權限下的加工貿易業務，分析加工貿易發展情況；研究和推廣各種新型貿易方式；辦理省內各類企業進出口經營權的審核、申報和登記；負責全省國際貨運代理企業的審核申報和進出口企業資質證書的發放及年審；指導和協調相關企業參加上述在國外舉辦的活動；審查和管理外商、港澳臺商在我省的代表機構；聯系進出口商會。
世貿組織事務協調辦公室
負責世貿組織規則和協議的研究和應用；負責收集、整理和報告世界各國WTO動態和投資貿易法律法規；開展與世貿組織有關的宣傳和培訓；承擔世貿組織規則和協議的咨詢和服務；建立和管理全省外經貿政策數據庫。
外國投資促進辦公室
研究擬定全省吸引外資的發展戰略、規劃和相關政策並組織實施；指導和管理全省招商引資工作；按照國家產業政策，會同有關部門，制定和發布重點投資項目；協調和指導重大海外投資促進活動；參與重大項目的談判。
外國投資管理辦公室
貫徹執行國家吸引外資的政策和法規；配合有關部門申報或審批外商投資項目，負責申報限額以上、國家限制和涉及配額許可證管理的外商投資企業及其分支機構；按照規定權限審批外商投資企業、中外合作企業、中外合資企業、華僑和港澳臺同胞的合同、章程；負責外商投資企業投資總額內進口設備的審核和確認；會同有關部門監督檢查外商投資企業執行有關法律、法規和合同的情況，協調解決問題；負責外商投資企業中技術先進型和產品出口型企業的認定；指導和管理外商投資企業進出口，申報或審批外商投資企業進出口配額、許可證商品指標；負責全省外商投資統計工作。
黨委
負責機關和直屬事業單位的黨群工作，日常工作由人事部門承擔。
對外經濟合作辦公室
研究擬定全省對外承包工程、勞務合作和國際服務貿易中長期規劃和年度控制目標，並組織實施；負責對外經濟技術合作經營權的審核申報和勞務派遣的審批管理；負責境外(含敏感地區)承包工程、勞務合作、設計咨詢項目的審批及相關經營許可的年審；協調和管理雙邊政府間經濟技術合作項目和聯合國及外國非政府組織提供的無償援助項目；負責我省境外勞務培訓機構設立的審核和申報。
開發區管理處
會同省有關部門研究擬定全省經濟技術開發區、出口加工區和保稅區的發展規劃和政策措施；負責國家級和省級開發區設立的審查和申報工作；調查分析開發區、出口加工區和保稅區的發展情況，提出相關建議；協調和指導各類經濟開發區、出口加工區和保稅區的建設和規範管理。
海外投資管理處
貫徹國家鼓勵境外投資的政策和措施；研究制定全省境外投資發展規劃並組織實施；會同有關部門審批或審核申報各類境外投資項目和境外代表機構，歸口管理在我省境外設立的各類經貿企業；推動企業在境外設立帶料加工裝配和資源開發項目，積極發展跨國經營；負責境外企業生產經營的統計和分析；負責申報和管理我省承擔的各類對外經濟援助項目。
亞洲分部
貫徹中國對本地區國家(地區)的經貿政策；負責本地區各國(地區)經濟貿易的綜合調查和分析；協調我省與區域內各國(地區)政府的雙邊和多邊經貿關系；研究提出促進我省與本地區國家(地區)經貿合作的規劃、招商引資、投資和市場開發的建議，推動我省與本地區國家(地區)的經貿合作；負責與本地區各國(地區)使領館商務咨詢處(處)的業務聯系；承擔盧鑫經貿局的日常工作，會同有關辦事處組織我省與新加坡、巴州、澳大利亞、南澳的三方合作，協調省駐新加坡代表處的工作。
美達廚
執行中國對本地區國家的經貿政策；負責本地區各國經濟貿易的綜合調查和分析；協調我省與本地區各國政府的雙邊和多邊經貿關系；研究提出促進我省與區內國家經貿合作的規劃、招商引資、投資和市場開發的建議，推動我省與區內國家的經貿合作；負責與本地區各國使領館商務咨詢處(處)的業務聯系。
歐洲和非洲司
執行中國對本地區國家的經貿政策；負責本地區各國經濟貿易的綜合調查和分析；協調我省與本地區各國政府的雙邊和多邊經貿關系；研究提出促進我省與區內各國經貿合作的規劃、招商引資、投資和市場開發的建議，推動我省與區內各國的經貿合作，負責與區內各國使領館商務咨詢處的業務聯系，協調省駐德國巴伐利亞州代表處的工作。
科技發展和技術進出口辦公室
研究擬定全省技術貿易中長期規劃和對外技術貿易的政策措施；負責管理和協調全省技術進出口和成套設備及高新技術產品出口；負責全省技術貿易引進、設備進口和國際招標的組織管理；審批限額內的技術貿易合同；管理國家限制或禁止的技術和進口技術的轉口業務；負責申報中央外貿發展基金；負責外經貿科技發展、技術進步、出口商品質量、信息化和標準化工作。
商務聯絡處(青島)
負責與海關、出入境檢驗檢疫、出口退稅局、中國銀行、中國進出口銀行青島代表處等金融部門的外經貿協調工作；負責協調和管理駐青島各單位的日常工作。
離退休幹部辦公室
負責機關離退休人員的管理和服務；指導所屬單位退休人員的管理和服務工作。
駐辦公室紀檢組和監察員辦公室
負責對部黨組和黨員領導幹部貫徹執行黨的路線、方針、政策、國家法律法規和決議命令的情況進行監督和檢查；負責查處處級以下幹部違反黨紀政紀的案件和下屬單位監察對象違紀違法的案件；協助黨組搞好黨風廉政建設和黨風黨紀廉政教育；維護黨員幹部和公務員依法行使職權。受理對黨員幹部和公務員違紀行為的檢舉、控告和申訴；完成省紀委、監察廳、廳黨組和主要行政領導交辦的其他工作。