1、計劃階段，包括初步評價被審計單位的內部控制系統、分析審計風險和編制審計計劃。
2、實施階段，包括進駐被審計單位、進壹步檢查和評價內部控制系統（包括風險評估、控制測試和實質性程序）、審查會計報表及其所反映的經濟活動和收集審計證據。其中，風險評估是必要程序，實質性程序在每次會計報表審計中都必須執行。
3、完成階段，包括全面評估錯報風險，整理、評價審計證據，復核審計工作底稿，歸納總結形成審計結論，最後出具審計報告。
審計程序指註冊會計師從接受客戶委托業務開始至對會計報表出具審計報告為止所經過的審計工作步驟。