會計信息系統的目標應服從於企業、信息系統、會計三者的目標。
企業的目標是通過提供客戶滿意的服務獲取更多的利潤。
信息系統的目標是向信息系統的使用者提供決策有用的信息。
會計的目標是要提高企業的經濟效益以獲取更多的利潤。
由此，會計信息系統的目標可以確定為向企業內外部的決策者提供需要的會計信息及對會計信息利用有重要影響的其他非會計信息。