註冊會計師考試的全科證書和專業階段證書是兩種不同的考試證書。
註冊會計師職業階段考試單科考試合格成績有效期為5年。對連續五個年度考試中專業階段考試各科目成績合格的考生，財政部考試委員會將頒發註冊會計師專業階段考試合格證書。也就是說，考生參加會計、審計、財務成本管理、公司戰略與風險管理、經濟法、稅法六門考試並取得合格成績，即可獲得職業資格證書。取得專業階段證書是參加綜合階段考試的必要條件。
財政部考試委員會將向綜合考試科目成績合格的考生頒發註冊會計師全國統壹考試通用執業證書。取得普通證書才有資格申請成為註冊會計師協會的執業或非執業會員。