克扣勞動者工資是違法的，因為沒有法律依據。所以事業單位工作人員的工資不會被會計扣除。
事業單位是指國家機關或者其他組織利用國有資產舉辦的以社會公益為目的，從事教育、科技、文化、衛生等活動的社會服務組織。