職工福利基金的來源包括:壹是按結余的壹定比例提取的職工福利基金；二是根據人員定額，從業務費或營業外支出中提取的職工福利費，在專用基金中核算。但兩者有區別:職工福利基金主要用於集體福利支出，如集體福利設施費用、後勤服務部門補貼、單位食堂補貼、職工公費醫療超支按規定由單位承擔的費用，以及國家規定可由職工福利基金支付的其他費用。按規定標準提取的福利費主要用於職工個人支出，單位用於職工生活困難補助等職工基本福利費。在壹些具體的支出項目中，福利基金和福利費也可以合並。
按照余額的壹定比例計提的職工福利基金的會計分錄為:借方:余額分配。
貸款:專用基金-職工福利基金
按職工人數定額提取的職工福利費會計分錄如下:
借:業務支出
貸款:專用基金-職工福利基金
使用時，其會計分錄為:借:專用基金-職工福利基金貸:銀行存款或現金。