壹是賬面查疑法
查賬時要註意兩種傾向的賬目。壹種是記錄混亂，賬證不符，賬實不符，加總賬有誤，記錄不完整，收支憑證內容不合法，手續不健全，甚至有塗改、挖補、偽造的憑證等。可運用核對法，進行賬實核對、明細賬與總賬核對，看“小金庫”是否存在。
另壹種是記載過於規範的賬目，賬面上毫無違紀，甚至連壹筆招待費都沒有。有的是筆跡筆劃壹致的謄抄賬。這類賬可能是假賬，假賬背後就有“賬外賬”或“小金庫”問題。檢查方法同查混亂賬目相同，但重點是對賬外收支項目的檢查。
賬面查疑還要註意賬面上違反常規的奇異問題，包括奇異的數字金額，奇異的時間、地點，奇異的收支事項等。例如，賬面上有司機工資支出而沒有車輛購置費、維修費、油料費，沒有生產經營項目的單位出現了生產經營費用，甚至有些單位無建築項目而發生建築材料購置等，這些奇異問題的背後可能就隱藏著“小金庫”。
二是層層剖析法
僅從被查單位賬目上難以發現“小金庫”，壹定要對有疑點的收支項目分類排隊，采用抽樣延伸的方法，從可疑科目到其下屬單位、被管理單位、被收費罰款單位以及發生業務較多的單位，層層剖析，使被查單位存在的收入不入賬、虛列支出、虛撥款項等問題原形畢露。
三是突擊盤庫法
在被查單位無準備情況下，用突擊方式盤點其全部金庫，並與現金日記賬、銀行存款日記賬及總賬核對。發現庫存現金與賬面余額不符，應當查明原因。若庫存現金數大於賬面余額，又不能說明正當來源，就是賬外“小金庫”。若庫存現金數小於賬面余額，查詢去向不明，則可能為貪汙或挪用。此外，還要註意檢查充抵庫存現金的借條、現金支票、支票存根及發生時間編號、銀行存款折、記事本等。發現疑點應進壹步追查收付款憑證，支票手續是否健全，內容是否合規合法，時間編號是否順序相聯。若在這些環節上發現了賬外資金的證據，則說明可能存在“小金庫”。
四是處置及出租資產追蹤法
單位處置淘汰的辦公用具、家具、設備、交通通訊工具及其他廢料、殘次品、包裝物、副產品、低值易耗品、更新替換下的固定資產處理殘值、出租閑置的固定資產等收入往往易被忽視，或因疏於管理流人個人腰包，或因單位故意作弊，收入不入賬，充填“小金庫”。因此，對這類資產應作為檢查的主要內容，從購進使用追蹤到處置、出租，壹追到底。發現收入不入賬，就說明存在“小金庫”或貪汙問題。
五是票據抽查法
單位的收支票據憑證應全部記賬，有存根聯、發票聯，有的還有出、入庫聯，並按順序編號。抽查票據時若發現收入不入賬，各聯數額不壹致，大頭小尾，缺頁少號等問題，就可能有隱瞞收入、設“小金庫”或虛報冒領等問題。
六是銀行對賬法
要求被查單位提供基本存款賬戶，專用存款賬戶，臨時存款賬戶等。結合銀行存款項、銀行對賬單，進行查詢核對。若發現銀行存款項與實際存款數額有差異時，應進壹步追查原因。實際存款數大於賬面余額又不能說明正當理由的，就可能是“小金庫”。此外，查詢時，還應特別註意以單位財務人員、法定代表人的名義或奇異的代名代號的存款，若其收支頻繁，數額較大，也可能是公款私存的“小金庫”。
七是成本分析法
成本被稱作是企業調整利潤的“蓄水池”，隱瞞收入的“避風港”，為謀取本單位利益，截留收入，填充“小金庫”資金，其手段之壹就是多攤亂擠成本。因此，應進行成本分析，檢查企業是否嚴格按規定核算產品成本、正確計算收入，看其是否存在用收入填充“小金庫”或舞弊貪汙等問題。分析采購成本時，要註意其在原、輔材料采購中，有無舍近求遠、舍優求劣、高價購劣、多支付運雜費、包裝費等問題；分析生產成本時，重點是查固定資產折舊的計提方法是否壹致，計算是否正確，原輔材料費、燃料動力費、工資福利費、企業管理費等支出是否合法合理，各期配比是否大體壹致，如某項費用某壹時期出奇的高，則應查明原因；分析銷售成本時，除檢查銷售費用開支外，還要檢查銷售折扣、折讓是否真實合法，銷售退貨是否驗收入庫和進行賬務處理。
八是產量推算法
有的生產性企業以少報產量，做假賬等手法，隱瞞收入、偷漏稅、設立“小金庫”。對於這類企業可根據其生產規模、生產能力、開工時間、原材料耗量、電力動力消耗量以及管理費用消耗量等指標，比照同類企業和被查企業不同年度的生產情況，綜合推算其產量。正常情況下，這些指標的配比應在壹定的合理範圍內。若被查企業賬面反映的產量與實際推算產量差異較大，指標配比異常，就說明該企業可能存在少報產量隱瞞收入、偷漏稅、私設“小金庫”等問題，應進壹步查證核實。