1遵循法律法規的有關規定和符合單位實際情況的原則
應該了解、分析各單位內部實際情況和外部環境對會計控制的影響。設計內部會計控制制度，切不可照搬照抄其他單位的內部會計控制制度。特別需要說明的是，設計的制度首先要適合經營目標，促進單位經營目標的實現。其次要適合單位組織結構，有效的制度要使單位會計信息迅速地上傳下達，保證聯絡渠道的暢通，要做到責權分明，對組織中每個部門、每個人實現有效會計控制，都需要組織結構來保證。任何壹個單位總是處於壹定的經營環境之中，經營環境的變化必然會對單位形成壹定的外部機會與外部威脅。盡管外部機會與威脅不在單位內部控制範圍之內，但在設計內部會計控制制度前對經營環境特點及其發展規律進行了解和分析，這樣設計出的內部會計控制制度，才能有效規避外部風險，實現內部會計控制的目標。
2全面性和系統性的原則
全面性包含兩層含義。壹是指內部會計控制制度的觸角滲透到單位各項業務過程和各個操作環節，覆蓋所有的部門和崗位。由於會計工作貫穿於單位整個經濟活動，是對單位整個經營管理活動進行會計核算和會計監督，因此制定會計控制制度要求全面。二是指內部會計控制制度對全體員工都有約束力，即制度面前人人平等，也指在設計過程中，充分聽取和吸取執行人員的意見和建議，發揮員工的積極性，使員工自覺執行制度。由於單位是壹個普遍聯系的整體，因此，制度設計要有系統論的觀點，即把單位作為壹個整體來考慮。要將各部門和各崗位形成既相互制約又具有縱橫交錯關系的統壹整體，以保證各部門和各崗位均能按照單位的目標相互協調地發揮作用。同時，內部會計控制制度要與其他內部控制制度相互銜接，形成目標統壹的內部控制制度，從而發揮內部會計控制制度的總體功能，實現內部會計控制的總體目標。在設計內部控制制度時，運用系統論的觀點與系統方法的整體性、全面性、層次性、相關性和動態平衡性等特征，設計出縱橫交錯的內部會計控制網絡與點面結合的控制系統。
3體現內部牽制的原則
內部牽制是指在部門與部門、員工與員工及各崗位間所建立的互相驗證、互相制約的關系，其主要牲是將有關責任進行分配，使單獨的壹個人或壹個部門對任何壹項或多項經濟業務活動無完全的處理權，必須經過其他部門或人員的查證核對。從縱向來說，至少要經過上下兩級，使下級受上級的監督，上級受下級的牽制，各有顧忌，不敢隨意妄為；從橫向來說，至少要經過兩個互相不隸屬的部門或崗位，使壹個部門的工作或記錄受另壹個部門工作或記錄的牽制，借以相互制約。在設計內部會計控制制度的過程中，壹項經濟業務活動各項環節盡量由不同部門處理，也可以委托社會中介組織，發揮其比較客觀、公正的作用。比如，在工程項目業務中，委托具有相應資質和專業能力的社會中介組織編報項目建議書等；在銷售業務活動中發票的開具環節由財務部門的人員處理而不是由銷售部門的人員處理，目的在於增強牽制作用。堅持牽制制度，需要明確各單位和部門的職能與性質，明確各部門及人員應承擔的責任範圍，賦予其相應的權限，職責與權力必須盡可能以規範文件的方式明確地授予具體的部門、崗位和人員，以免發生越權或在出現錯誤或舞弊時相互推諉扯皮。
4講究成本效益原則
實行內部會計控制制度本身就是通過完善的內部控制，降低成本和人為因素，最在限度地提高單位的經濟效益。如果實行這項制度所花費的成本大於其本身所能帶來的效益，就不存在實行內部控制的必要性。因此，對重要經濟業務活動要進行重點控制，對壹項經濟業務活動的關鍵環節實行重點控制。選擇關鍵控制點，是實現少花費而高效率控制的重要途徑。