跨年5月31日前匯算清繳，全年應交所得稅額減去已預繳稅額，正數是應補稅額：
借：以前年度損益調整
貸：應交稅金—應交企業所得稅
繳納年度匯算清應繳稅款：
借：應交稅金—應交企業所得稅
貸：銀行存款
重新分配利潤
借：利潤分配—未分配利潤
貸：以前年度損益調整
年度匯算清繳，如果計算出全年應納所得稅額少於已預繳稅額：
借：應交稅金-應交企業所得稅（其他應收款—應收多繳所得稅款）
貸：以前年度損益調整
重新分配利潤
借：以前年度損益調整
貸：利潤分配-未分配利潤
經稅務機關審核批準退還多繳稅款：
借：銀行存款
貸：應交稅金—應交企業所得稅（其他應收款—應收多繳所得稅款）
對多繳所得稅額不辦理退稅，用以抵繳下年度預繳所得稅：
借：所得稅
貸：應交稅金—應交企業所得稅（其他應收款—應收多繳所得稅款）
免稅企業也要做分錄：
借：所得稅
貸：應交稅金—應交所得稅
借：應交稅金—應交所得稅
貸：資本公積
借：本年利潤
貸：所得稅
匯算清繳和會計分錄處理年度終了，企業應根據“本年利潤”科目有關資料，計算出本年實現的利潤總額。企業應按規定將利潤總額進行調整，包括彌補上年度虧損，減除已繳納所得稅的投資利潤等，調整後的余額，就構成企業本年度的應納稅所得額。按本年度應納稅所得額乘上規定的稅率，就得出企業的應納稅額。企業如果有來源於境外的所得，其已在境外繳納的所得稅稅額，按規定從應納稅額中扣除。
企業在匯算清繳時，計算的實際全年應納稅額多於全年已預繳的所得稅稅額，其少交的部分，應於下壹年度繳納時補繳。
計算出少繳的稅款時，作如下會計分錄：
借：所得稅
貸：應交稅金—應交所得稅
實際補繳少繳的稅款時，作如下會計分錄：
借：應交稅金—應交所得稅
貸：銀行存款
多繳的部分，可在下壹年度抵繳。
企業所得稅減免稅的會計處理
按照稅法規定，企業在享受減免稅優惠措施時，應將減、免的應納稅額計算入帳，並按規定進行納稅申報。企業按規定計算出應納稅額時，作如下會計分錄：
借：所得稅
貸：應交稅金—應交所得稅
實行先繳後退的企業，按規定交納稅款時，作如下分錄：
借：應交稅金—應交所得稅
貸：銀行存款
企業按規定收到退回的所得稅稅款時，作如下分錄：
借：銀行存款
貸：應交稅金—應交所得稅
同時作：
借：應交稅金—應交所得稅
貸：盈余公積
上年利潤調整所得稅會計處理
企業年度決算報表經有關部門審核後，對發現的上年度會計事項，如果是涉及損益的，應對上年利潤總額和利潤分配進行調整，計算出多繳或少繳所得稅，辦理補繳或退稅手續。
企業按規定調整上年利潤，如調整增加上年利潤或調減上年虧損時，作如下分錄：
借：有關科目
貸：利潤分配—未分配利潤
對調整增加的利潤，應按規定補繳所得稅，作如下分錄：
借：利潤分配—未分配利潤
貸：應交稅金—應交所得稅
實際繳納所得稅時，作如下分錄：
借：應交稅金—應交所得稅
貸：銀行存款
調整減少上年利潤或調整增加上年虧損時，作如下分錄：
借：利潤分配—未分配利潤
貸：有關科目
由於調減利潤而應退回的稅款，作如下分錄：
借：應交稅金—應交所得稅
貸：利潤分配—未分配利潤
按規定辦理退稅手續，收回稅款時，作如下分錄：
借：銀行存款
貸：應交稅金—應交所得稅