組織協調分支機構的日常工作，組織行長辦公會議、常務會議和重要工作會議，承辦文秘、信息整合、外事、信訪、保密、檔案和新聞報道，督辦全行重要事項。負責組織分公司黨委，承擔黨委日常事務，監督黨委重要事項。
法律事務辦公室
負責審查相關規範性文件，開展法律研究；積極推進依法行政，加強執法監督；擔任分公司的法律顧問，出具法律意見；開展金融法律咨詢服務、相關金融法律事務和金融法制宣傳教育；承辦行政復議和行政訴訟；做好民事案件管理工作，切實維護央行合法權益。
貨幣和信貸管理辦公室
負責山東省經濟金融監測分析、再貸款、再貼現、存款準備金、利率、信貸政策、金融市場監測及相關監管工作。
金融穩定司
監測和評估山東省金融體系風險，研究落實防範和化解系統性金融風險的政策措施；管理中央銀行的金融穩定資產和金融穩定再融資；根據國家有關政策，參與金融體制改革，推進轄區金融體制改革；根據總行相關規定，參與處理風險及其他金融穩定相關事宜。
調查和統計司
負責收集、統計和分析山東省經濟金融信息；組織實施金融業綜合統計制度，管理和協調金融機構統計工作；按照有關規定，發布山東省金融統計數據，向山東省政府和金融機構提供信息咨詢服務。
會計和財務辦公室
負責山東省人民銀行會計財務制度的組織實施和監督檢查；承擔山東省人民銀行系統財務、基建、固定資產和集中采購管理工作。
支付和結算辦公室
負責山東省支付結算體系建設，會同有關部門研究制定相關支付結算規則，制定支付結算、非現金支付工具和賬戶管理的相關制度措施和實施細則，並組織實施，維護山東省正常的支付結算秩序；開展支付體系研究和創新，組織推廣非現金支付工具；組織山東省人民銀行集中核算。
科學技術部
負責山東省人民銀行科技建設和管理，以及辦公自動化系統和業務應用系統的規劃、建設和維護；協調銀行卡聯網的壹般工作。
貨幣金銀辦公室
負責山東省貨幣發行、金銀管理、發行倉庫管理和防偽工作。
財政部
山東省國庫經理；管理山東省各級國庫業務，監督管理征收辦公室和代理銀行辦理國庫業務。
內部審計局
負責山東、河南兩省人民銀行內部審計制度規章制度的貫徹實施；對工作人員依法履行公務和執行財經法規、財經紀律的情況進行監督檢查，對違法違紀人員提出處理建議；承擔相關的績效審計和離任審計。
人事部(黨委組織部)
負責山東、河南兩省人民銀行的幹部、專業技術人員、勞動工資、機構編制和職工培訓管理工作；負責黨在山東、河南兩省人民銀行的組織和統戰工作；承辦山東省人民銀行的全面保險工作。
金融研究室
負責圍繞貨幣政策決策，分析預測山東省經濟增長和運行情況，跟蹤研究貨幣信貸等各項政策執行情況和經濟金融運行中的深層次、重大問題，提供決策建議；負責山東省金融學會秘書處的日常工作，組織出版《金融發展研究》，推動山東省金融研究的發展。
征信管理處(中國人民銀行征信中心山東分中心)
管理山東省征信業，推進社會信用體系建設；承擔山東省所轄企業和個人信用信息基礎數據庫的建設、運行和管理。
反洗錢處
負責反洗錢法律、行政法規和政策要求在山東省的貫徹實施，組織協調山東省反洗錢工作，指導部署山東省金融業反洗錢工作。
外匯總局
組織協調國家外匯管理局山東分局的日常工作，承擔分局局長辦公會議、局長辦公會議和重要工作會議的組織工作；負責綜合、文秘、宣傳、檔案、信訪、保密等工作；辦理行政復議案件；負責外匯管理政策法規的咨詢和解釋；負責外匯信息研究；配合和協助國家外匯管理局和中國人民銀行內部審計部門對外匯業務進行審計；負責經濟特區的外匯管理。
國際收支辦公室
負責山東省國際收支和外匯收支統計制度的建立和實施；對山東省國際收支和外匯收支進行監測、預警和分析；國際收支統計申報的現場和非現場檢查；管理山東省外匯指定銀行結售匯業務、銀行間外匯市場運行和人民幣匯率實施。
當前項目管理辦公室
負責山東省經常項目外匯管理；監督檢查經常項目下的結匯行為，預先審核經常項目下超比例、超金額售付匯的真實性；辦理進出口收付款的核銷；監督管理經常項目下的外匯賬戶。
資本項目管理辦公室
負責山東省資本項目外匯管理；依法管理資本項目下的交易和外匯的匯入、匯出及支付；管理山東省境內機構借入境外商業債務資金、發行外幣債券、對外擔保、對外債權等資金交易和往來，對外債和對外擔保進行登記和統計監測；審查還本付息情況；審核境外直接投資的外匯資金來源；審核境內機構在境外發行上市的外幣股票的兌換事宜。
外匯檢查處
依法監督檢查在山東省從事外匯收支活動的機構執行法律法規的情況；查處違反外匯管理法規的行為；協助有關司法部門和行政執法部門查處外匯違法案件。
郵政監管中心
負責人民銀行濟南分行會計、發行、國庫、外匯業務的事後監督；為山東省人民銀行的後監管工作提供業務指導。
安全部門
承擔山東省人民銀行系統安全工作。
離退休幹部辦公室
負責分支機構退休人員管理工作，指導人民銀行山東、河南兩省退休人員管理工作。
黨委宣傳部
負責黨在山東、河南兩省人民銀行的宣傳工作。
共青團委員會
負責山東、河南兩省人民銀行的共青團工作。
紀委(監察室)
負責山東、河南兩省人民銀行紀檢監察工作。
紀檢監察壹科
負責紀委(監察室)的文字綜合、服務協調和文件管理；負責人民銀行山東、河南兩省的信訪受理、反腐倡廉宣傳教育、紀檢監察幹部培訓和案件審理、申訴、復議、復查工作；負責收集整理紀檢監察信息；負責糾正行業不正之風和行風建設。
紀檢監察二科
負責山東、河南兩省人民銀行黨風廉政建設和領導幹部廉潔自律監督檢查工作；負責查辦和預防違法違紀案件、執法監督、黨內監督和行政監督；負責源頭反腐工作的組織、協調、監督和檢查。
巡邏辦公室
負責綜合協調、政策研究、制度建設、文件起草、巡視人員管理、後勤保障，了解和掌握市區分行、分行營業管理部巡視工作情況，承辦分行黨委巡視工作領導小組交辦的其他事項。
機關黨委辦公室
負責分公司黨委的日常工作。
工會辦公室
負責山東、河南兩省人民銀行工會工作。
票據交換中心
負責支付系統濟南城市處理中心的日常業務運行和系統運維；負責保障和完善山東省支付系統關聯相關業務系統的準入條件；負責向所有支付系統參與者提供必要的操作和維護指導；承擔相關系統監控和維護服務；負責指導山東省人民銀行系統科技處維護和管理支付系統運行。
物流服務中心
負責分公司的後勤支持和安全。