企業被批準合並後，要對固定資產、流動資產、無形資產、長期投資和其他資產進行全面清查登記，進行資產清查，同時對所有資產損失和債權債務進行全面清查核實。財產清查過程中發現的盤盈、盤虧、毀損、報廢等情況，應當分別處理:
1.對於各種材料、材料的盤虧或毀損，借記“待處理財產損溢——待處理流動資產損溢”科目，貸記“原材料”、“產成品”、“應交稅費——應交增值稅(轉出的進項稅額)”科目。各種材料的盤盈，借記“原材料”等科目，貸記“待處理財產損溢——待處理流動資產損溢”科目。對原材料采用計劃成本核算的企業，還應同時結轉材料成本差異。
2、盤虧固定資產時，借記“待處理財產損失和盤盈——待處理固定資產損失和盤盈”、“累計折舊”科目，貸記“固定資產”科目。報廢、毀損的固定資產應轉入清算，按固定資產凈值借記“固定資產清算”科目，按已計提折舊借記“累計折舊”科目，按固定資產原價貸記“固定資產”科目；清理收入和清理過程中剩余材料的價值，借記“銀行存款”、“原材料”科目，貸記“固定資產清理”科目；發生的清理費用，借記“固定資產清理”科目，貸記“銀行存款”科目。固定資產清算後，收入借記“固定資產清算”科目，貸記“營業外收入——處置固定資產凈收益”科目；對於固定資產清算後的凈損失，區別對待:因自然災害等非正常原因造成損失的，借記“營業外支出——非常損失”科目，貸記“固定資產清算”科目；正常處理損失的，借記“營業外支出——處理固定資產凈損失”科目，貸記“清理固定資產”科目。盤盈的固定資產，按重置完全價值，借記“固定資產”科目，按新舊預計折舊，貸記“累計折舊”科目，按重置完全價值減去預計凈折舊，貸記“待處理財產損溢——待處理固定資產損溢”科目。
3.按規定轉銷各種材料和有存貨損失或毀損的材料時，按殘值借記“原材料”等科目，按保險賠償和過失賠償的可收回金額借記“其他應收款”等科目，貸記“待處理財產損失及溢余——待處理流動資產損失及溢余”等科目；屬於非常損失的，借記“營業外支出——非常損失”，貸記“待處理財產損失及溢余——待處理流動資產損失及溢余”科目；屬於壹般經營損失的，借記“管理費用”科目，貸記“待處理財產損失及溢余——待處理流動資產損失及溢余”科目。按照規定轉售各種材料和物資，借記“待處理財產損溢——待處理流動資產損溢”科目，貸記“管理費用”科目。
4、按規定轉售固定資產時，借記“營業外支出——固定資產盤虧”科目，貸記“待處理財產損溢——待處理固定資產損溢”科目。按照轉售固定資產的規定，借記“待處理財產損失及溢余——待處理固定資產損失及溢余”科目，貸記“營業外收入——固定資產盤盈”科目。
5.對於按規定無法收回的賬款，經批準采用直接轉售方式的，借記“管理費用”科目，貸記“應收賬款”科目；采用備抵法的，借記“壞賬準備”科目，貸記“應收賬款”科目，壞賬準備不足核銷的部分，也借記“管理費用”科目，貸記“應收賬款”科目。對於不能償還的賬款，按規定轉售時，借記應付賬款等科目，貸記營業外收入。
6.對於潛在損失、產成品存貨損失和尚未處理的損失，經主管財政機關批準後，沖銷盈余公積和資本公積，不足部分沖銷實收資本，借記盈余公積、資本公積、實收資本科目，貸記“待處理財產損失和溢余”、“利潤分配——未分配利潤”科目。
二、資產評估的會計處理
企業兼並壹經批準，應按規定由法定資產評估機構對企業資產進行評估，評估後的資產報國有資產管理部門審批確認，並作如下處理:
1.企業應當根據經批準的評估確認的資產價值，調整相關資產的賬面價值。流動資產、長期投資和無形資產，應按評估確認的價值與賬面價值的差額，借記(或貸記)“資本公積”科目。
2.對於固定資產，應按評估確認的固定資產原值與固定資產原賬面價值的差額，借記(或貸記)“固定資產”科目，按兩者的差額，貸記(或借記“資本公積”科目，貸記(或借記“累計折舊”科目。
三、舊賬核算的終結。
(1)被合並企業的會計處理失去法人資格的企業結束舊賬時，借記全部負債和所有者權益賬戶的余額，貸記全部資產賬戶的余額；保留法人資格的企業可以繼續使用原企業賬簿，也可以結束舊賬簿，另立新賬簿。企業無論是繼續使用原企業賬簿，還是新設賬戶，都應當將被合並企業的全部凈資產轉為實收資本。
(二)被合並企業的會計處理1。被合並企業喪失法人資格時的處理:
(1)有償合並的，按照每次資產評估確認的價值，借記全部資產，按照交易價格與評估確認的凈資產的差額，借記“無形資產-商譽”，按照確認的負債金額，貸記全部負債，按時確定的交易價格，貸記“專項應付款-被合並企業應付賬款”。企業支付價款時，借記“專項應付款——應付被合並企業款項”科目，貸記“銀行存款”科目。
(2)以無償劃轉方式進行合並的，按照資產負債評估確認的價值，借記全部資產，貸記全部負債，兩者有差異的，貸記實收資本。
2、被兼並企業仍保留法人資格。
(1)企業有償合並其他企業，作為投資處理，按支付的價款借記“長期投資”科目，貸記“銀行存款”科目。
(2)企業以無償劃轉方式取得被合並企業資產的，按照所劃轉的凈資產，借記“長期投資”科目，貸記“實收資本”科目。
3、被兼並企業享受的會計處理優惠政策。
(1)“優化資本結構”試點城市經濟效益好的國有企業兼並困難國有企業的，享受免息、停息優惠政策，並按《關於困難國有工業生產企業兼並優勢國有企業後銀行貸款利息會計處理的通知》的規定辦理。
(2)被兼並企業為政策性虧損的，產權轉讓交易後，被兼並企業可在原批準的被兼並企業政策性虧損補貼範圍內繼續享受壹定期限的虧損補貼，按規定計算應收補貼時，借記“應收補貼”科目，貸記“補貼收入”科目；收到補助時，借記“銀行存款”科目，貸記“應收補助”科目