辦理銀行承兌匯票的程序如下:
(1)銀行承兌匯票的付款人或承兌申請人向銀行提出申請，經銀行同意後，由承兌銀行簽發承兌商業匯票，以保證到期無條件付款。銀行承兌匯票是商業信用與銀行信用相結合的信用票據，銀行承兌本質上是銀行對外信用擔保的壹種形式。承兌銀行按票面金額向承兌申請人收取千分之壹的承兌手續費。受理費每筆不足10元的，按10元收取。
(2)收款人或被背書人即將到期的銀行承兌匯票，連同填制的匯款或匯款委托收款憑證，送銀行轉賬，根據銀行的收款通知編制收款憑證。收款人向銀行申請對未到期的商業匯票貼現時，應按要求填制貼現憑證，連同匯票壹並送交銀行，並根據銀行的托收通知，編制收款憑證。
(4)承兌申請人在銀行承兌匯票到期前將款項支付給收款人、被背書人或貼現銀行。付款單位收到銀行的付款通知後，會據此編制付款憑證。承兌申請人在銀行承兌匯票到期日未足額存款的，承兌銀行除根據匯票向收款人、被背書人或貼現銀行無條件付款外，還應根據承兌協議的規定，將未折回的承兌金額轉讓給付款人(承兌申請人)的貸款人，進行逾期貸款， 從承兌申請人處扣錢，對未扣的承兌金額每天加收萬分之五的罰息。
為了加強商業匯票的管理，企業應指定專人負責商業匯票的管理，並設立？“應收應付票據備查簿”，詳細記錄每張應收應付票據，到期結清票據，在備查簿中逐壹註銷。