壹般按照納稅人申報流轉稅時的銷售額或營業額計算。堤圍防護費的使用將嚴格按照限定的使用範圍，專項用於河道治理、清淤維護、排水設施、堤防、小型水庫等堤圍工廠的建設和維護。堤圍防護費計入企業生產經營成本，允許在征收所得稅時扣除。
堤圍費的會計處理
壹般堤圍費應計入企業管理費賬戶，設置二級明細賬戶堤圍費。具體處理如下:
堤圍費計提時:
借:管理費-堤圍費
貸:應交稅費-應交堤圍費。
支付堤防費時:
借:應交稅費-堤圍費
貸款:銀行存款
堤圍費的計稅方法
堤圍費按營業額或銷售額為計算基數全額計算。堤圍防護費=應稅營業(銷售)額流轉稅×適用征收率
堤圍防護費的征收標準應按當期營業額計算，對經營模式不同的企業按不同稅率征稅:外貿企業、從事商品批發和零售的企業、個體工商戶按0.7‰征稅；其他行業堤圍防護費按1.2‰征收。