醫學院的前身是1998年創辦的九江市丹福醫院附屬護士學校和1951創辦的江西省第三醫學院。1955成為江西省九江醫學院，1958升級為九江醫學院。2002年參與創辦九江學院。已有100年歷史，培養了2萬多名醫學、醫學、護理、技術等專業人才。醫學院現有教職工100人，其中專任職稱16人，省級骨幹教師7人，博士6人，碩士28人，碩士生導師7人。學校有4000多名學生。其中，九江醫學院附屬醫院由原九江醫學院附屬醫院(現東院)和原九江市第二人民醫院(現西院)合並而成。是九江市科室齊全、技術力量雄厚的具有三級醫院功能的大型綜合性醫院。
醫院具有橫跨旬陽東西兩端的獨特地理優勢，匯聚了東西院優秀人才的精華。現有職工703人，其中主任醫師和正教授15人，副主任醫師和副教授81人，研究生6人，碩士研究生5人，床位505張，臨床醫學科45個，病房10間，年門診量32萬余人次，居九江市同行之首。
醫院擁有全身彩色超聲診斷儀、經顱彩色多普勒儀、CT、C型臂x光機、碎石機、全自動生化分析儀、腹腔鏡、前列腺汽化電切鏡、電子胃鏡、纖維鼻竇鏡、喉鏡、超聲乳化儀等壹大批先進的醫療設備。，擁有精良的設備和科學的診斷。
學院附屬新住院樓醫院堅持科教興院戰略，實施“面向21世紀，服務人民”的前瞻性人才戰略。擁有壹大批德才兼備的專家和學科帶頭人，壹批特色鮮明的重點專科，並與武漢同濟醫院建立了技術合作，為解決疑難病癥提供了強有力的技術保障。九江市眼病防治中心、九江市醫療美容中心、九江市耳鼻喉科實驗室均設在該院。皮膚科、性病防治中心、眼科、耳鼻喉科、神經內科、心血管內科、肝膽外科、泌尿外科、針灸、婦科等。在全市及周邊地區率先開展。眼科人工晶狀體植入術、超聲乳化術、耳鼻喉科氣管食管異物取出術、鼻腔鼻竇良性腫瘤及早期惡性腫瘤切除術、普外科胰腺切除及十二指腸切除術、胃癌根治術(R4分級)、直腸癌擴大根治術保留自主神經及腹腔鏡微創手術、胸外科食管癌、肺癌切除術、骨外科肱骨骨髓移植、骨質疏松規範化治療、顯微外科、 手外科、脊柱外科、脊柱骨折前路減壓、Kanade內固定、脊柱後路椎弓根螺釘內固定、脊椎滑脫等手術處於江西省領先水平，人工關節置換術、泌尿外科自體睪丸移植、體外腎取石術、自體腎移植、腦外科腦出血患者微創手術、顱骨血管瘤切除術等疑難手術取得突破，前列腺電汽化術、兒科兒童發育咨詢門診處於九江市領先水平。 產科設備，技術過硬，服務壹流。骨科、腦外科等科室近年來發展突飛猛進，成為全市同行的排頭兵。
龐大的專科門診和專科門診陣容以其良好的口碑和鮮明的特色，在市內同行中具有無可比擬的優勢，在贛鄂皖三省及周邊地區享有盛譽，慕名而來的患者絡繹不絕。“壹切為了病人，壹切為了病人，壹切為了病人”是醫院的最高準則。長期以來，附屬醫院以壹流的服務質量和服務水平得到了群眾的好評，在九江樹立了良好的整體形象。醫院是九江市文明單位、文明規範服務示範窗口單位。有壹支技術過硬的高素質服務團隊，堅持醫德醫風壹票否決制和醫德醫風建設壹次性投訴等候制。國際ISO-9000質量認證標準在系統化整體護理中的應用，在全市乃至全省產生了較大影響，得到了衛生部、省衛生廳、市衛生局等各級領導和社會各界的充分肯定和好評。被市衛生系統先進集體、市衛生局號召，在全市推廣該院系統化整體護理經驗。省內外30余家醫院前來參觀學習，患者滿意率達95%以上。
新建的住院大樓配有中央空調、中央吸引、中央供氧等現代化設施。每個病房都有衛生間，病房四季如春，在優雅的環境中為患者創造了舒適宜人的休息場所。