到現在為止，他還不知道，有數次懷疑過，如下幾集中有體現：
1、TV007中，每月壹份禮物威脅事件（第壹次懷疑柯南是新壹，結果博士用變聲器打了圓場）
2、TV096-97中， 走頭無路的名偵探--連續兩大殺人事件（小蘭發現壹張她和新壹小時侯的照片,發現柯南和新壹小時候長得壹模壹樣,差點被識破，後來新壹媽媽回來幫了新壹，說柯南是親戚小孩）
3、TV188-TV193中，這六集的危命的復活系列小蘭都在懷疑，後來灰原給柯南制作了臨時解藥變大成新壹，他自己用變聲器扮成柯南，瞞過了小蘭
4、TV400心存疑惑的蘭
5、劇場版3 世紀末的魔術師
劇情簡介
高中生偵探工藤新壹和青梅竹馬的同學毛利蘭壹同去遊樂園玩的時候，目擊了黑衣男子的可疑交易現場。只顧偷看交易的工藤新壹，卻忽略了從背後接近的另壹名同夥。他被那名男子灌下了毒藥，當他醒來時，身體居然縮小了！
如果讓那些家夥知道工藤新壹還活著的話，不僅性命難保，還會危及身邊的人。在阿笠博士的建議下他決定隱瞞身份，在被小蘭問及名字時，化名江戶川柯南，為了搜集那些家夥的情報，寄住在父親以偵探為業的小蘭家中。
謎團重重的黑衣組織……他所了解的，就只有他們是以酒的名稱作為代號的。為了揭露那些家夥的真面目，小小偵探江戶川柯南的活躍開始了。
參考鏈接：
百度百科：名偵探柯南