已有港澳通行證辦理簽註的情形，分為第壹次辦理；非首次辦理簽註；自助辦證大廳的自助機辦理等，具體如下：
1、第壹次辦理
第壹次辦理港澳臺通行證不需要簽註，在首次辦理的時候已經公安局會默認簽註。公安機關出入境管理部門單獨受理簽註申請後，應當在7個工作日內予以簽發。因所在地區交通不便或者因特殊情況，不能按期簽發的，經省級公安機關出入境管理部門批準，簽發時間可以延長至20個工作日。
按照國家移民管理局有關規定在非常住戶口所在地申請往來港澳通行證、簽註的，公安機關出入境管理部門應當在20日內予以簽發。
2、非首次辦理簽註
如果非首次辦理簽註，則需要按照續簽流程辦理續簽手續。需要本人親自到當地公安分局出入境辦證大廳去辦理，或者網上辦理續簽。續簽需要材有：本人港澳通行證、本人身份證原件和復印件、2寸淺藍背景免冠照片壹張。
3、自助辦證大廳的自助機辦理
自助辦證大廳的自助機：點擊左上角的續簽按鈕，選擇電子通行證簽註。插入電子通行證後，選擇前往地和次數。核對好個人的申請信息後點擊下壹步。等待制卡，然後核對制卡信息。最後取卡就可以了。
不需要其常住戶口所在地公安機關出入境管理部門受理的情形
1、內地居民申請赴香港或者澳門商務，須由其工作單位所在地公安機關出入境管理部門受理。
2、內地居民通過勞務經營公司申請赴香港或者澳門就業，須由勞務經營公司所在地地級以上（含地級，下同）公安機關出入境管理部門受理。
3、軍人申請赴香港或者澳門，須由部隊或者工作單位駐地公安機關出入境管理部門受理。
4、內地居民持往來港澳通行證和逗留簽註，在香港或者返回內地期間，再次申請往來港澳通行證及逗留簽註，可以由其原逗留簽註受理審批部門或者廣東省公安廳深圳出入境簽證辦事處（以下簡稱深圳簽證辦）受理。
5、內地居民持往來港澳通行證和逗留簽註，在澳門或者返回內地期間，再次申請往來港澳通行證及逗留簽註，或者申請赴香港其他簽註，可以由其原逗留簽註受理審批部門或者廣東省公安廳珠海出入境簽證辦事處（以下簡稱珠海簽證辦）受理。