流感病毒分類根據流感病毒感染的對象，可以將病毒分為人類流感病毒、豬流感病毒、馬流感病毒以及禽流感病毒等類群，其中人類流感病毒根據其核蛋白的抗原性可以分為三類:
甲型流感病毒，又稱A型流感病毒
乙型流感病毒，又稱B型流感病毒
丙型流感病毒，又稱C型流感病毒
感染鳥類、豬等其他動物的流感病毒，其核蛋白的抗原性與人甲型流感病毒相同，但是由於甲型、乙型和丙型流感病毒的分類只是針對人流感病毒的，因此通常不將禽流感病毒等非人類宿主的流感病毒稱作甲型流感病毒。
在核蛋白抗原性的基礎上，流感病毒還根據血凝素和神經氨酸酶的抗原性分為不同的亞型。