主要區別是，科屬不同、形態特征不同、生境分布不同，具體如下：
壹、科屬不同
1、基圍蝦
基圍蝦壹般指刀額新對蝦，俗稱沙蝦、泥蝦，隸屬於甲殼綱、十足目、對蝦科、新對蝦屬。
2、南美白對蝦
別稱凡納對蝦、白肢蝦、白對蝦、凡納濱對蝦，隸屬於甲殼綱、十足目、對蝦科、對蝦屬。
二、形態特征不同
1、基圍蝦
體色土黃到棕褐色，遊泳足棕色或赤色。體表除脊、邊緣部分及腹部兩側前下方外，有許多短毛，體表分布許多黑點。額角雄性平直，尖刀形，雌性末端略向上彎。第壹步足具座節刺。額角6~9齒，腹部第壹至第六節背面具有縱脊，尾節無側刺，第壹步足具座刺，但比基節刺小。
2、南美白對蝦
正常體色為青藍色或淺青灰色，全身不具斑紋。步足常呈白堊狀，故有白肢蝦之稱。頭胸甲較短，與腹部的比例約為1:3；額角側溝短，到胃上刺下方即消失，頭胸甲具肝刺及鰓角刺，肝刺明顯，第1觸角具雙鞭，內鞭較外鞭纖細，長度大致相等，但皆短小，腹部第4～6節具背脊，尾節具中央溝，但不具有緣側刺。?
三、生境分布不同
1、基圍蝦
在我國主要分布於福建、臺灣、廣東和廣西沿海，常棲息於沙泥質或泥沙質底海區，對環境適應能力強，喜潛伏於底質中，適溫範圍為12~37℃，最適水溫為25℃~28℃，高於33℃或低於16℃時，攝食量明顯減少。
2、南美白對蝦
原產於南美太平洋沿岸的水域，主要分布在美國西部太平洋沿岸熱帶水域，從墨西哥灣至秘魯中部都有分布，以厄瓜多爾附近的海域更為集中。自然棲息區為泥質海底，水深0～72米。成蝦多生活在離岸較近的沿岸水域，生長的適宜水溫為13～40℃，生長的最適溫度為23～30℃。水溫低於16℃時開始停止攝食。
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