火影忍者手遊中的忍者級別分為S、A、B、C四個等級，每個等級又分為不同的忍者，S級忍者有31位，A級忍者有62位，B級忍者有128位，C級忍者有61位，***282個。
火影忍者手遊中的忍者獲取方式有多種，可以通過精英副本、高級招募、忍者商店、團購忍者、直購忍者、組織活動以及忍法貼捆綁活動等方式獲取。