1、胃腸潰瘍者少喝檸檬泡水：檸檬水味道酸，在檸檬果肉中含有較多的酸性物質，酸性物質會刺激胃酸分泌，適量飲用檸檬水可以促進食物消化，改善消化不良癥狀，但是胃腸潰瘍者本就胃酸分泌過多，如果再大量喝檸檬水更會加劇對潰瘍面的刺激，從而會導致病情加重。
2、不宜空腹飲用檸檬水：檸檬水中含有大量的有機酸成分，在空腹狀態下，胃內沒有食物的幹預，飲用檸檬水後，檸檬水中的酸性成分會刺激到胃腸壁，從而容易引起腸胃不適等癥。
3、沖泡檸檬溫度不宜過高：沖泡檸檬壹般用溫水，因為過高的溫度會釋放出檸檬皮中的苦味物質，而且用熱水泡檸檬，檸檬中的維生素C成分也會遭到破壞；另外，若是溫度過低的話，檸檬中的芳香成分不易泡出，維生素C也很難析出，所以沖泡檸檬水時要註意沖泡溫度，壹般建議用60-70度的溫水沖泡即可。
4、沖泡濃度不宜過高：在檸檬中含有大量的果酸，沖泡檸檬水的時候，濃度過高會刺激腸胃，引起腸胃不適，因此，壹般在沖泡檸檬水時，1-2片檸檬就可以沖壹大杯水。
5、壹次性飲用量不宜過多：每天喝檸檬水的話，喝2-3杯即可，不宜超過1000毫升，適量喝檸檬水可以起到美容養顏、促進消化、減肥瘦身等作用，但是如果飲用過多，其酸性成分反而會刺激到胃腸壁，引起腸胃不適癥狀。
6、齲齒者不宜喝檸檬泡水：檸檬水中有機酸豐富，有機酸除了促進胃液分泌外，還具有刺激牙釉質的作用，經常喝檸檬水對於牙釉質有損傷作用，還會引起或者加重齲齒的情況。
7、糖尿病者不宜喝檸檬泡水：檸檬雖然味道是酸的，但是檸檬果肉中糖分含量也不低，因此糖尿病者不宜吃檸檬或者喝檸檬水。
8、睡前慎喝檸檬泡水：檸檬水中含有壹定量的糖分，睡前喝容易導致人體血糖升高，睡前代謝緩慢，這些糖分還可能會轉化為脂肪儲存在人體中，所以壹般是不建議睡前喝檸檬水的。
9、飲用後不宜曬太陽：檸檬是壹種感光水果，在檸檬皮中，含有檸檬烯、香豆素類等感光物質，食用檸檬後容易使皮膚變得敏感，喝了檸檬水之後出去曬太陽，少部分皮膚敏感的人可能會出現皮膚發紅、易曬黑等情況，所以喝檸檬水後最好少曬太陽。