48 外交官殺人事件（前篇）服部平次首次出現
49 外交官殺人事件（後篇）柯南第壹次變成工藤新壹
57 福爾摩斯迷殺人事件（前篇）
58 福爾摩斯迷殺人事件（後篇）服部平次發現柯南身份
76 柯南VS怪盜基德第壹個特別篇1小時 怪盜基德與柯南正式對決
96 走投無路的名偵探！連續兩大殺人事件2小時特別篇
118 浪花連續殺人事件服部平次再壹次出現
129 來自黑暗組織的女子 大學教授殺人事件主線！灰原哀出現
132 魔術愛好者殺人事件（事件篇）
133 魔術愛好者殺人事件（疑惑篇）
134 魔術愛好者殺人事件（解決篇）怪盜基德出現
162 飛天密室 工藤新壹最初的事件1小時特別篇
174 20年的殺意 新佛尼號連續殺人事件2小時特別篇
176 與黑暗組織的再會（灰原篇）
177 與黑暗組織的再會（柯南篇）
178 與黑暗組織的再會（解決篇）不用說……主線！
188 危命的復活 偵探隊洞窟遇難記
189 危命的復活 名偵探負傷記
190 危命的復活 第三個選擇
191 危命的復活 黑衣騎士
192 危命的復活 新壹回來了柯南第二次變為工藤新壹
193 危命的復活 約定的地點
208 通往迷宮的入口 巨大神像的憤怒1小時特別篇
219 被召集的名偵探！工藤新壹VS怪盜基德2小時特別篇 看標題就知道很好看……
263 大阪雙重謎團 浪花劍士和太閣城服部平次出現 2小時特別篇
286 工藤新壹紐約事件（事件篇）
287 工藤新壹紐約事件（推理篇）
288 工藤新壹紐約事件（解決篇）回憶殺……
304 震動的警視廳 1200萬名人質挺驚險的 2小時特別篇
323 服部平次壹籌莫展！（前篇）
324 服部平次壹籌莫展！（後篇）
345 與黑衣組織直面對決 滿月之夜的雙重謎案主線 2小時半特別篇
356 怪盜基德令人驚異的空中漫步
383 甲子園的奇跡！絕不能輸給看不見的惡魔2小時特別篇
406 柯南和平次的推理魔術（機關篇）
407 柯南和平次的推理魔術（宅第篇）
408 柯南和平次的推理魔術（解決篇）
425 黑色沖擊！組織魔爪伸來的瞬間2小時半特別篇 主線！
462 黑暗組織的影子 小小的目擊者
463 黑暗組織的影子 奇妙的照明
464 黑暗組織的影子 謎樣的高額報酬
465 黑暗組織的影子 珍珠流星
469 怪盜基德與四幅名畫（前篇）
470 怪盜基德與四幅名畫（後篇）怪盜基德出現
472 工藤新壹少年冒險（前篇）
473 工藤新壹少年冒險（後篇）回憶殺……
479 和服部平次***度的3天服部平次出現 2小時特別篇
487 本廳刑事戀愛物語7 左手的無名指[1小時特別篇]
488 電視臺的惡魔[1小時特別篇]
489 法庭的對決Ⅲ 目擊者是檢察官[1小時特別篇]487 488 489這三個可看可不看 可自行決定……
490 服部平次VS工藤新壹 滑雪場的推理對決1小時特別篇
491 紅與黑的碰撞 開端
492 紅與黑的碰撞 血緣
493 紅與黑的碰撞 絕叫
494 紅與黑的碰撞 冥土
495 紅與黑的碰撞 昏睡
496 紅與黑的碰撞 侵入
497 紅與黑的碰撞 覺醒
498 紅與黑的碰撞 攪亂
499 紅與黑的碰撞 偽裝
500 紅與黑的碰撞 遺言
501 紅與黑的碰撞 嫌疑
502 紅與黑的碰撞 潔白
503 紅與黑的碰撞 決死
504 紅與黑的碰撞 殉職這個系列和沖矢昴有點關系 由於集數偏多 妳實在不想看的話看最後壹集就行……
507 卡拉OK包房的死角（前篇）
508 卡拉OK包房的死角（後篇）在這個系列最後壹集末尾部分本堂瑛祐發現了柯南的真實身份
511 推理對決！新壹VS沖矢昴與沖矢昴有所關聯
515 怪盜基德的瞬間移動魔術1小時特別篇 值得壹看
521 殺人犯 工藤新壹
522 新壹的真實身份 小蘭的眼淚521和522值得壹看，都是1小時特別篇
537 怪盜基德VS最強金庫（前篇）
538 怪盜基德VS最強金庫（後篇）
587 基德VS四神偵探團
616 福爾摩斯的默示錄（名偵探的弟子）柯南吃了小哀的藥第三次變成工藤新壹和小蘭他們坐飛機去倫敦旅行
617 福爾摩斯的默示錄（Love is 0）
618 福爾摩斯的默示錄（撒旦）
619 福爾摩斯的默示錄（Code break）
620 福爾摩斯的默示錄（草場女王）
621 福爾摩斯的默示錄（0 is Start）末尾部分小蘭的回憶中新壹向小蘭表白
629 柯南基德的龍馬寶物攻防戰（前篇）
630 柯南基德的龍馬寶物攻防戰（後篇）
656 柯南VS平次 東西偵探推理對決1小時特別篇
657 毒與幻的設計（EYE）
658 毒與幻的設計（S）
659 毒與幻的設計（Poison）
660 毒與幻的設計（Illusion）與主線有關
712 漆黑的特快列車（發車）
713 漆黑的特快列車（隧道）
714 漆黑的特快列車（交叉）主線相關
715 漆黑的特快列車（終點）
735 怪盜基德與赤面人魚（前篇）
736 怪盜基德與赤面人魚（後篇）
745 茱蒂的追憶與賞花的陷阱1小時特別篇
757 怪盜基德VS京極真（前篇）
758 怪盜基德VS京極真（後篇）
775 柯南與平次 戀愛的暗號（前篇）
776 柯南與平次 戀愛的暗號（後篇）
780 灰原哀監禁事件（2月21日播出）