由黑寡婦史嘉蕾喬韓森飾演的女主角“草薙素子”在壹場事故中幸存下來，身體全都被機器化（又稱義體化），大腦所剩的部分組織，被壹個鈦合金腦殼所保護著，而小腦等負責運動機能的部分則被“電子腦”所替代。本片宗旨徹底呈現了“機器可能永遠不能成為人，但人可以成為機器。”
女主角在片中對於自身的困惑，也許就是未來人類定位自己存在的困惑：靈魂是獨壹無二的存在，然而肉體卻是可以大量復制、批量生產、能夠隨時被替換，呈現出完全分立的狀態，看著大量如出壹轍的肉體，如何才能確定自己靈魂的真實存在呢？
女主角在片中不斷尋找自我，最後重新進化，也是英文片名的意義GHOST IN THE SHELL，我們存在的意義就是因為人類是靈魂與軀殼兼具，軀殼可以不斷再生，靈魂卻只有壹個。當人的意識可以像資訊壹樣被自由的下載來下載去時，人的“存在”的是真實的嗎？
《攻殼》裏呈現了終極的人工智慧未來進化的結果，將演化成半生物半機器的Cyborg。Ghost不是自然的產物，也不是人造的，Ghost源自於人類本來的靈魂，但是身體已不是本來的身體，而是由高度的義肢和機器化代替了血肉。值得壹提的是，《攻殼》的真正內涵在於探討“人類與智慧”的問題。在《攻殼》的世界裏，既有高度智能化的機器人，也有高度機器化的人類，人與機械的界限變得模糊不清。