作物科學學院、林學院、資源與環境學院、計算機與信息學院、交通學院、經濟與管理學院、旅遊學院(聯合辦公)、人文社會科學學院、藝術學院、風景園林學院(聯合辦公)等8個學院19本科專業。在校生1300多人。
福建農林大學南平校區是原福建林學院，其辦學歷史可以追溯到20世紀50年代末。1958年秋，福建林學院在此成立，成為當時福建省“八大”本科院校之壹。40多年的辦學歷史，在福建林學院這片沃土上培養了10425位校友，壹大批政治精英、商界名人、專家學者在各自的行業中成就斐然。5438年6月至2000年10月，原福建農業大學和福建林學院合並組建福建農林大學。正式建校後，福建林學院所在地更名為“福建農林大學南平校區”。2004年9月以後，這所學院的所有新生都進入了福州的學校。南平校區是福建農林大學教學實踐和培養農村管理幹部的重要基地。2009年4月27日，福建農林大學南平校區隆重掛牌，恢復本科教育。同年6月6日，2009級第壹批1100余名新生順利進入南屏校區。
擁有1個國家重點學科，1個國家重點學科(培育)，1個國家科學生物學基地，2個農業部重點學科，1個國家林業局重點學科，18個福建省重點學科，8個博士後科研流動站，6個壹級學科，45個二級學科博士點。有11個壹級學科碩士學位授權點，78個二級學科碩士學位授權點，MBA等4個專業碩士學位授權點，15個高校教師在職攻讀碩士學位的學科和專業。有22個學院，68個本科專業，43個成人教育專業。涵蓋8個學科，本科生21000余人，研究生近3000人。教職工2300余人，其中專任教師1572人，專任224人，副高級職稱494人。福建省屬高校僅中科院院士1人，博士生導師96人。1984以來，1人被評為國家優秀專業技術人才，10人入選國家有突出貢獻的中青年專家，14人入選國務院學位委員會學科評議組成員，142人享受國務院政府特殊津貼，7人入選高等學校農林教學指導委員會委員1人入選教育部高等學校思想政治理論課教學指導委員會委員，1人入選教育部科學技術委員會委員，1人入選農業部科學技術委員會委員，2人入選教育部新世紀傑出人才支持計劃， 5人入選福建省優秀科技人員，2人入選福建省優秀教師，28人入選福建省優秀專家。 74人入選福建省“百千萬人才工程”人選，9人被評為全國優秀教師和教育工作者，37人被評為福建省優秀教師和教育工作者，11人被評為省級教學名師。
學校是教育部本科教學水平評估優秀高校，是第二批實施國家大學生創新實驗計劃的高校。目前，國家級精品課程6門，省級精品課程52門，國家級雙語教學示範課程1門，國家級實驗教學示範中心1個，省級實驗教學示範中心7個，國家特色專業建設點9個，省級特色專業建設點14個，國家級教學團隊2個，省級教學團隊8個，省級人才培養模式創新實驗區65438個。2009年獲國家級教學成果獎2項，省級教學成果獎6項。校內外建立了壹批教學科研實驗工廠，其中教學林場近31萬m2。學校圖書館有紙質圖書226萬冊，電子圖書91萬冊。建校74年來，共培養畢業生65438+萬人，為經濟建設和社會發展做出了積極貢獻。
學校擁有農業部海峽兩岸農業技術合作中心1、國家農業產業技術研究開發中心1、聯合國(中國)果蠅防治合作中心1、農業部重點實驗室2個、教育部重點實驗室2個、教育部工程研究中心1、科技部國際科技合作基地1和R&D及檢測中心4個1978以來，已有602個項目獲得國家、省部級科技獎和優秀社會科學成果獎，其中國家科技進步壹等獎、國家技術發明獎二等獎等國家三等獎6項，國家科學大會獎4項，國家合作三等獎9項。三年來承擔科研項目1093項，科研項目資助金額達3.62億元。獲得國家級、省級科技成果獎67項，省級優秀社科成果獎16項，鑒定(評)成果143項。學校長期以經濟建設為導向，以“6.18”為平臺，加快科技成果轉化。連續七年“6.18”對接並在所有參與高校和科研院所中獲得第壹名，產生了顯著的經濟效益和社會效益。
學校積極開展對外交流與合作，充分發揮與臺灣省內高校和科研機構深厚的地緣、血緣、學術和親緣優勢，不斷加強兩岸交流，拓展教學空間。與20多個國家和地區的大學和研究機構建立了友好關系，開展了教學和科研方面的合作與交流。學校已成為具有招收外國留學生和港澳臺僑學生權利的機構，並率先招收臺灣省農業行業協會會員學習成人教育。該校與加拿大新斯科舍農業學院合辦了兩個本科專業教育項目:園藝、農業資源和環境。學校學報(自然科學版、哲學社會科學版)面向國內外公開出版，還編輯出版了《林業經濟問題》、《亞熱帶農業研究》、《武夷科學》、《華東昆蟲學報》、《高等教育理論與實踐》等刊物。
學校先後榮獲全國精神文明建設先進單位、全國綠化模範單位、全國先進基層黨組織、全國教育系統紀檢監察工作先進單位、全國紅十字模範學校、全國無償獻血促進獎、福建省五壹勞動獎、福建省先進基層黨組織、福建省文明學校(連續三次)。“福建省黨建和思想政治工作先進高校”(連續兩屆)、“福建省綠色學校”、“福建省平安校園”等。，連續21年被評為“全國大學生暑期下鄉社會實踐活動先進單位”。