住院醫師以臨床實踐、專業必修課和公共必修課為主要培訓內容，分兩個階段通過考試取得相應的課程學分。
培訓方式:臨床實習以在職培訓為主，科室指導。自學是外語及專業的主要必修課。部分公共必修課和選修課通過業余班面授完成，也可以通過自學和參加課程水平考試獲得學分。
工作滿5年，學分符合要求，臨床能力考核合格後頒發住院醫師培訓證書，作為申請中級專業技術職務任職資格的必要條件。部分申請臨床醫學學位的在職臨床醫師，從事臨床工作3年以上，完成住院醫師規範化培訓第壹階段並考核合格，可授予住院醫師規範化培訓資格證書。