1.行政體制:大熊貓基地的主管部門是住房和城鄉建設部，主管成都市住房和城鄉建設局。大熊貓中心的主管部門是林草局，直接主管。
2.分支:大熊貓基地有兩個分支，成都基地和同家。大熊貓中心有四個分支機構，分別是臥龍神樹坪基地、都江堰青城山基地、雅安碧峰峽基地和核桃坪野化訓練基地。
3.名氣和聲譽:大熊貓中心很有名。畢竟是從“中國”開始。在宣傳上，大熊貓基地碾壓大熊貓中心。
總的來說，中心熊貓和基地熊貓在行政系統、分支機構、名氣和聲譽上有壹些不同。