仙林大學城位於南京市城市總體規劃確定的仙林副城西北部，北臨棲霞區和南京經濟技術開發區(國家級)，南臨靈山山脈，西接土城頭路，東臨規劃城市二環路。作為仙林副城集中發展區的大學城，仙林大學城由大學集中區和科技產業區組成，面積47平方公裏，其中二環以西、土城頭路以東、靈山以北、312國道以南的27平方公裏為大學集中區。計劃用3-5年時間建設9-10所大學和壹批中小學，面積約為。規劃二環以東20平方公裏為大學城科技產業區，集中高等教育資源優勢，促進教育科研成果轉化，發展IT、ic、生物制藥等高科技產業，為國際知名大學預留3000畝用地。(圖集)
仙林大學城建設的指導思想是:按照突出生態環境、突出人文內涵、突出信息優勢、體現規劃高起點、體現社區建設智能化、體現人與自然和諧統壹的思路，按照統壹規劃、分步實施、突出重點、整體推進、保留收費、滾動發展的思路，經過3-5年的努力， 努力把仙林大學城建設成為最具影響力、國際知名的人與自然和諧統壹的生態、功能、開放的大學城，促進教育、科技、經濟的緊密結合，為南京新世紀的可持續發展提供智力支持、人才保障和地域空間。