1.利益困境:全面深化改革會觸動部分既得利益者的利益。克服這壹困境的方法之壹是建立合理的利益補償機制，以確保受影響的利益相關者在改革過程中能夠平衡他們的利益。
2.組織惰性:許多組織是惰性的，對變革有很高的抵抗力。為了克服這壹問題，有必要進行激勵和培訓，建立變革的動態機制，並確保充分的信息交流和參與。
3.政策協調:改革涉及許多領域的政策調整和協調。為了應對這壹挑戰，需要建立跨部門協調機制，加強政策整合，確保不同改革方案的壹致性和協同性。
4.執行力不足:改革需要高效的執行力，但在實際操作中，可能存在能力不足、責任不清等問題。為了解決這壹問題，可以通過加強培訓、提升工作流程來提高執行效率，同時建立明確的責任體系，確保改革責任落實到位。
5.社會風險:壹些改革會導致社會不穩定和沖突。為了應對這壹困難，需要進行全面的社會風險評估，采取相應的防範和化解措施，同時加強公眾參與和溝通，增強社會的接受度和認知度。