現有職工98人，其中研究員13人，副研究員19人，博士5人，碩士19人，享受國務院特殊津貼人員14人，農業部有突出貢獻專家3人，中國農業科學院傑出人才10人。有微生物研究中心、沼氣工程研究中心、培訓與信息研究中心、農村能源研究中心、生物質能研究中心、農業部沼氣產品及設備質量監督檢驗測試中心和四川省沼氣工程技術研究中心。長期從事沼氣、生物質能開發利用研究，形成了集環境科學、生態學、經濟學、管理學、生物學、物理學、化學、發酵技術、加工技術、社會科學為壹體的綜合性專業人才隊伍，在國內同行業處於領先地位。本人擁有強大的研發力量，研究領域涵蓋了農村生物質能開發利用的大部分領域。包括農村沼氣、大中型沼氣工程、微生物、沼氣發酵、裝備技術、燃料乙醇、稭稈固化、生物柴油等。
30年來，研究所主持和參與了國家科技支撐計劃、國家重大專項、國家“973”、“863”計劃、國家科技攻關項目、國家自然科學基金、部省重點項目等壹系列科技項目。先後承擔並完成國家和省級科研項目300多項，以及其他多項，其中30多項科技成果獲得國家和省級獎勵。完成或參與完成大中型沼氣工程500余項，涉及工業有機廢水、城市生活汙水、大型畜禽養殖場廢棄物厭氧消化處理及達標排放處理。
在農村戶用沼氣技術、大中型沼氣工程、稭稈沼氣技術等領域開展了大量研究工作，形成了較為成熟的農村戶用沼氣池新池型、新技術、高濃度有機廢水處理及其達標排放、畜禽養殖場糞便處理技術、農作物稭稈沼氣供應站發電技術等。我單位設計的蒙牛奧亞示範牧場大型沼氣發電綜合利用項目是目前國內最大的奶牛養殖場糞汙處理沼氣項目。由於項目地處高寒地區，在低溫和自然條件下，厭氧消化產沼氣是壹個很大的考驗。同時，本項目熱電聯產的實施顯示了可再生能源的優勢和價值。
經農業部批準，1990成立了農業部厭氧微生物重點開放實驗室，是我國唯壹的跨學科的農業部能源微生物重點實驗室。長期致力於能源微生物學基礎理論和應用研究，在沼氣發酵主要微生物種群基礎理論研究、厭氧高活性顆粒汙泥形成機理、超高溫厭氧纖維素酶基因克隆、特殊環境產甲烷菌基因克隆等方面居全國前列。同時，實驗室還開展了高效纖維素乙醇、制氫、油脂生產、石油地質微生物等壹系列前沿研究。目前，我所已收集和保存了約300種兼性和特異性厭氧微生物，是我國產甲烷古菌資源最多、生物多樣性最豐富的科研單位。
中國市政府於1981與聯合國開發計劃署簽署協議，成立“亞太地區沼氣研究與培訓中心”，負責承擔中國商務部援外培訓項目，幫助發展中國家發展沼氣技術。自成立以來，該中心已成功舉辦了44期沼氣和可再生能源技術培訓班，培訓了來自亞洲、非洲和拉丁美洲108個國家的1013名沼氣技術人員。迄今為止，我們已與前來學習、考察、訪問、合作和交流的各國政府官員和學術團體建立了廣泛的合作關系。
當今世界能源危機、氣候變暖、環境惡化，生物質能技術在解決能源和環境問題上有著非常廣闊的前景。近年來，我院的研究工作已從單純的沼氣技術逐步拓展到生物質能資源綜合利用技術的研究領域。未來將在燃料乙醇、生物油、生物氣等生物能源轉化及裝備技術研究、能源植物資源研發、農業廢棄物資源及環境生態綜合研究等領域拓展項目。同時，計劃通過政府、非政府組織以及雙邊或多邊國際合作等多種渠道，為發展中國家組織相關領域的培訓。