(1)加強業務指導，夯實財務管理基礎？
1.加強對成員思想的引導。落實《農民專業合作社法》和《農民專業合作社財務會計制度(試行)》，加大宣傳力度。將合作社成員培訓納入農村勞動力素質培訓，有針對性地對合作社成員進行財務管理知識培訓。壹是對合作社理事會成員進行培訓，使合作社理事會成員掌握必要的財務管理知識。二是培訓合作社監事會成員，使他們掌握必要的民主理財知識。三是對普通社員進行培訓，告知其權利義務，提高其財務管理水平，使社員了解合作社的財務公開材料，激發其參與合作社管理的積極性，關心合作社的財務運行。
2.加強對合作社會計人員的業務指導。將農民專業合作社的會計制度和方法及時下發到各合作社，並將典型合作社的標準化會計處理流程，包括標準化自制原始憑證格式，以內部資料的形式下發到各合作社，以供參考。同時建立壹些長效機制。第壹，建立合作理財顧問制度。充分利用農經隊伍的業務優勢，從鄉鎮農經人員中選拔有事業心、能鉆研業務的人員組成合作社財務輔導員，與合作社開展壹對壹的業務指導，提高合作社財會人員的管理能力和業務水平。二是建立合作核算中心。組織專業會計人員代理合作社記賬，降低合作社聘請專職會計人員的成本。三是建立合作會計師培訓制度。作為合作會計，必須經過必要的業務知識培訓，考試合格後才能上崗。鼓勵會計人員通過繼續教育及時更新知識，以適應新的要求。
(二)加強制度建設，確保資產和資金的安全完整。
切實建立健全合作社財務管理的各項制度，做到主任有章可循，按章辦事。制度建設要兼顧政策性、實用性和可操作性，認真做好合作社財務收入管理、財務支出審批、財務預決算、資金管理崗位責任和財務公開等制度建設，確保合作社資金安全；切實做好合作社資產托管清查、資產臺賬登記、資產評估和資產管理等制度建設，確保合作社資產的安全完整；切實做好合作社貨幣資金、采購、銷售、投融資等內部控制制度建設。，保證協同核算信息的準確性和運行的高效性。通過集體討論制定並公布各項管理制度。
(三)加強會計核算，規範財務管理。
1.規範財務管理機構設置。農民專業合作社應當加強對財務工作的管理，設立財務管理職能部門，設置會計、出納和保管崗位。可以根據業務需要設置會計科目。規模小、業務簡單的合作社可以委托農村經營管理機構或者代理記賬機構記賬。出納應由專職人員擔任，不得是監事會成員或董事長，實物保管應由熟悉業務的人擔任。確保財務人員必須持證上崗，特別是會計和出納必須有會計從業資格證書才能從事財務工作。
2.規範貨幣資金的審批和使用程序。現金收入必須及時記錄，會計和出納應及時對賬。嚴禁不入賬收入、私設“小金庫”、白條抵庫、公款私存。所有費用由經辦人簽字，監事會審核，董事長批準。重大項目支出由理事會或會員代表大會討論決定，並建立責任追究制度，防止貪汙、侵占和挪用資金。有扶持資金和項目資金的，要專款專用。
3.規範票據的使用和管理。建議在省級行政區域內實行農民專業合作社票據統壹監管制度，由財政、農業主管部門負責監管票據種類，設計票據格式，規範填報要求。稅務機關加強對農民專業合作社的銷售監管，規範農民專業合作社的銷售發票，銷售發票統壹使用稅務機關提供的發票，然後本著“先試行，後推廣”的原則，逐步在壹個省或壹個地區推廣。統壹財務票據理順財務核算。
4.規範會計流程。首先，農民專業合作社應當按照《農民專業合作社財務會計制度》的規定，結合自身的管理需要和業務特點，統壹會計科目，建立會計制度，設置會計賬簿，包括總賬、存款日記賬、庫存現金賬簿、股本明細賬、會員匯兌明細賬、產品及材料明細賬、固定資產明細賬、采購及代銷明細賬等。再次，要根據財務會計制度的規定，正確核算經濟業務，定期向會員公布財務情況，使每個會員對資金的使用情況心中有數，增強財務管理的透明度。第三，合作社應當按照財務會計制度的規定，準確、及時、完整地編制資產負債表、盈余及盈余分配表、成員權益變動表、賬戶余額表、收支明細表等會計報表和財務報表，準確反映合作社當前的財務狀況和經營成果。要努力提高會計報表的編制水平，應滿足報表與報表之間的相互核對關系，並積極將編制的會計報表及時報送登記機關和當地農村經營管理部門，接受監督和指導。
5.規範收入分配。社員賬戶是合作社社員利益的載體，要依據合作社法律設立社員賬戶，完善收益分配制度，兼顧公平與效率。從以下兩個方面入手，第壹，認真履行合作社法中關於盈余分配的規定。合作社應當根據自身發展情況和成員大會形成的決議提取壹定比例的盈余公積，依法為每個成員設立成員賬戶，按照章程量化為每個成員的份額，計入個人賬戶，並以國家直接財政補貼和他人向成員捐贈的形式平均量化財產。二是根據本合作社的發展情況，合理確定盈余返還、分紅和分紅的比例。可分配盈余按成員與合作社的交易量(金額)比例返還，返還總額不低於可分配盈余的60%；其余可按出資比例和盈余公積份額、財政補助資金形成財產的量化份額、捐贈財產的量化份額分配給成員。合作社要建立盈余支付機制，將提取的盈余及時足額支付給成員，堅決杜絕虛報盈余、不及時足額支付甚至不支付成員的現象。總之，要認真分析農民專業合作社財務管理中存在的問題，從多方面尋求解決辦法。只有不斷完善農民專業合作社的財務管理，提高合作社財務管理的規範性，才能促進其持續、快速、健康發展。