向當地縣級食品藥品監督管理局申請保健品經營許可證，然後繼續在工商部門辦理個體工商戶營業執照。需要的材料有:身份證原件及復印件、店鋪的產權證明(如房產證復印件或土地證復印件)、租賃合同原件及復印件、證件照片、保健品營業執照原件及復印件。在領取營業執照後30日內，向當地地稅和國稅機關申請辦理稅務登記證。
保健食品生產許可程序如下:
1、保健食品企業營業執照申請表；
2.工商行政管理部門核發的預先核準證書和營業執照復印件；
3、新開辦企業提供法定代表人、企業負責人資格證書復印件、身份證復印件；
4.營業場所證明文件復印件；
5、營業場所的現場平面布置圖、企業衛生管理組織文件、衛生質量管理體系目錄；
6.從業人員健康體檢證明復印件和從業人員保健食品衛生知識培訓材料；
7.申請人不是法定代表人或者負責人本人的，應當提交企業的授權委托書；
8、食品藥品監督管理部門認為有必要提供的其他資料。
法律依據:
保健食品管理辦法
申請保健食品批準證書時，必須提交以下材料:
(壹)保健食品申請表；
(二)保健食品的配方、生產工藝和質量標準；
(三)毒理學安全性評價報告；
(四)健康功能評估報告；
(五)保健食品的功能性成分清單，以及功能性成分的定性和/或定量檢驗方法和穩定性試驗報告。因為在現有技術條件下，無法明確功能性成分，必須提交食品中與保健功能相關的主要原料清單；
(六)產品樣品及其衛生檢驗報告；
(七)標簽和說明書(樣本)；
(8)國內外相關信息；
(九)根據有關規定或產品特點應當提交的其他材料。