根據《管理辦法》，自貿試驗區建立了與開放型經濟新體制相適應的管理體制，促進了行政管理方式改革與體制機制改革的協調聯動，提高了行政管理效率。中國(江蘇)自由貿易試驗區南京片區、蘇州片區、連雲港片區管理委員會(以下簡稱片區管委會)負責具體落實片區改革試點任務，統籌協調片區經濟和行政事務，並承擔相關職責。
省有關部門積極支持自貿試驗區發揮改革試驗田作用，及時出臺特殊政策措施，支持自貿試驗區落實各項改革試點任務，推動自貿試驗區改革試點經驗復制推廣，在土地、環保、規劃、資源利用等方面給予適度傾斜。
在深化開放合作方面，自貿試驗區對外商投資實行準入前國民待遇加負面清單管理制度。繼續加大先進制造業、教育培訓服務業、法律服務業、知識產權服務業等現代服務業的對外開放力度。自貿試驗區將擴大開放合作，積極引進高技術、高成長、高附加值企業，加快優勢產業集聚。
在留住人才方面，自貿試驗區建立健全人才培養機制，積極探索建設高素質專業化幹部隊伍的新路子，建立了“引進崗位、選派學生學習”的幹部培養機制。自貿試驗區將加大吸引高層次人才創業創新的力度，促進國內外專業人才雙向流動，為海外高層次人才入境、出境、工作、在華停留和居留以及他們的家人和未成年子女在中國生活和教育提供便利。
自貿試驗區探索實行年薪制、協議薪酬制等多種分配形式，優化調整高層次人才科技貢獻獎勵補償政策，加大產業緊缺高端人才獎勵補償力度，優化人才住房、落戶、醫療等配套政策，支持自貿試驗區探索海外高端人才和緊缺人才工資薪金個人所得稅差額補貼政策。
在創新金融服務領域，《管理辦法》明確規定，在自貿試驗區內依法設立外資銀行、民營銀行、保險公司、證券公司、基金公司、持牌資產管理機構等金融機構，確保依法平等經營。推進人民幣跨境使用，開展人民幣跨境創新業務。
優化營商環境，按照“放開”為原則，“不放開”為例外的原則，將省市兩級可下放的經濟社會管理權限下放至自貿試驗區。授權列表是動態管理的，根據發展需要及時調整。自貿試驗區將加大簡政放權、加強監管、改善服務的改革力度，推行“證照分離”等行政審批制度，推行“互聯網+政務服務”模式，加快政務信息互聯互通。
現代快報+/ZAKER南京記者張羽