辦理商標註冊網上申請的，應當按以下流程辦理：1、申請“商標數字證書”;僅商標代理組織需要進行本步驟的操作。2、下載並安裝數字證書驅動程序和安全應用控件;僅商標代理組織需要進行本步驟的操作。3、登錄網上申請系統，選擇書式，提交商標網上申請;4、繳納商標規費;商標代理組織應當在提交申請前向商標局足額預付商標規費。5、確認網上申請是否提交成功。成功提交商標網上申請後，商標局要求遞交相關紙質申請材料的，應當按規定辦理。
法律依據
《中華人民***和國商標法》第四條
自然人、法人或者其他組織在生產經營活動中，對其商品或者服務需要取得商標專用權的，應當向商標局申請商標註冊。不以使用為目的的惡意商標註冊申請，應當予以駁回。本法有關商品商標的規定，適用於服務商標。