深圳市深水海納水務有限公司是深水海納水務集團股份有限公司的前身，2015年已正式工商變更名稱為深水海納水務集團股份有限公司。
深水海納水務集團股份有限公司（股票代碼：300961）成立於2001年，是中國生態環境智慧治理綜合服務商，工業汙水處理領先企業，戰略聚焦工業汙水處理、優質供水和新能源領域，整合智能裝備、新材料、水處理藥劑等產業鏈業務，搭建智慧水務平臺，為客戶提供集“研發、設計、投資、建設、運營”於壹體的系統化解決方案，累計在全國建設/運營800余個環保水務項目。
1997年，率先在全國提出“管道直飲水”概念，梅林壹村管道直飲水項目正式開工建設。
1998年，梅林壹村管道直飲水項目被國家建設部列為“管道直飲水項目唯壹試點示範工程”。
1999年，梅林壹村管道直飲水工程全面供水。
2000年，主編國家建設部《生態住宅小區管道直飲水建設要點與技術導則》。
2001年，成立深圳市分質供水有限公司，聚焦管道直飲水業務，榮獲深圳市科技進步三等獎。
2002年，主編《深圳市經濟特區管道直飲水安全技術規範》。
2003年，主編《管道直飲水系統技術規程》、《飲用凈水水質標準》。
2004年，承接廣州大學城水廠運營項目，承建山東省東營安居工程直飲水項目，獲得深圳市高新技術企業證書。
2005年，更名為深圳市深水海納水務有限公司，提出“深水海納，服務百川”的品牌戰略構想。
2006年，深圳市寶安機場汙水處理廠項目正式運營，業務延伸至工業汙水處理領域。
2007年，承接新疆天利高新已二酸脫鹽水、汙水處理項目設計施工總承包並運營。
2008年，承建的北京奧運會地鐵直飲水項目投入運營。
2009年，承建第26屆世界大學生運動會直飲水運營項目。
2010年，取得江蘇省宿遷市泗陽縣供水項目特許經營權。
2011年，與韓國K-Water（水資源公社）及韓國KOLON集團締結戰略合作夥伴關系。
2012年，取得河南省靈寶市汙水處理廠項目特許經營權，承接北京古北水鎮分質供水與汙水再生利用零排放項目，獲得國家高新技術企業證書。
2013年，承接富德（常州）能源化工汙水處理項目，獲得ISO質量、環境、職業健康安全管理體系認證。
2014年，更名為深圳市深水海納水務集團有限公司，取得山東省菏澤市曹縣新醫藥產業園區汙水處理項目特許經營權。
2015年，獲得建築業企業資質證書（市政公用工程施工總承包二級），榮獲“廣東省著名商標”稱號，成功實施股份制改造，更名為深水海納水務集團股份有限公司。
2016年，取得山東省菏澤市曹縣經濟開發區相關汙水處理廠及配套管網PPP綜合項目特許經營權，獲得AAA資信等級證書、AAA企業信用等級證書、廣東省環境汙染治理能力評價證書（廢水甲級）。
2017年，獲批成立廣東省院士專家企業工作站、深圳市院士（專家）工作站，榮獲2017中國最具創新力企業、中國水務行業十大領軍品牌、環境保護科學技術獎壹等獎。
2018年，取得湖南省嶽陽市臨湘工業園區汙水處理廠、北京古北水鎮優質供水綜合項目運營權，榮獲全國工程建設質量金質獎、全國市政公用工程優秀承包商、2018最具投資價值獎。
2019年，取得山西省長治市屯留區煤化工工業園區汙水處理壹期工程PPP項目特許經營權、山東省菏澤市曹縣莊寨和青堌集汙水處理廠及配套管網PPP項目特許經營權，成為廣東省工業集聚區智慧環境工程技術研究中心建設單位，獲得兩化融合管理體系認證，榮獲廣東省守合同重信用企業、全國工程建設先進單位、創新環保先鋒企業、2019最具投資價值獎。
2020年，取得遼寧省丹東市東港工業汙水處理廠建設PPP項目特許經營權，獲得工程設計資質證書（環境工程設計專項水汙染防治工程乙級），成為廣東省科技專家工作站建設單位，廣東省專精特新企業，深圳知名品牌，榮登2020深圳企業500強榜單，上市申請通過創業板上市委2020年第38次審議會議審核。
2021年，獲得建築業企業資質證書（環保工程專業承包二級），取得黑龍江省齊齊哈爾市克山縣(2021)年二次供水管網、泵站改造工程項目，河北省滄州市黃驊市舊城鎮白莊園區汙水處理廠PPP項目及配套路網管網項目，雄安—故城產業生態城水生態系統建設特許經營權項目，以及張家口市陽原經濟開發區循環園汙水處理廠及基礎設施項目，榮登2021深圳500強企業榜單，成功登陸深交所創業板，股票代碼：300961。
2022年，成功中標外資企業瑪氏集團“瑪氏巧克力工廠汙水處理站改善升級項目”，斬獲貴陽市南明區五裏沖汙水處理廠二期建設工程，續簽北京密雲·古北水鎮（司馬臺長城）國際旅遊度假區給水廠項目的委托運營合同。山西省長治市屯留區煤化工工業園區汙水處理壹期工程項目等壹批項目順利竣工進入運營期，供水能力及汙水處理能力持續加強，大力拓展綜合智慧能源業務領域，打造第二增長曲線。獲批成立深圳市博士後創新實踐基地，榮獲“中國產學研合作創新示範企業”、“環保知名品牌企業”稱號，再次上榜“2022深圳500強企業”榜單。
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2021年 深交所上市