陳奕君和她那壹代的知識分子壹樣，從大學畢業到改革開放，經歷了四清、文革和長期的“再教育”，荒廢了自己的專業，卻收獲了許多獨特的社會和生活經驗，這也是她後來轉行進入社會學領域的動力之壹。
她於1978被中國社會科學院錄取，不久被派往加拿大阿爾伯塔大學學習。回國後，在費孝通教授領導的社會學研究所擔任《國外社會學》主編。在此期間，他翻譯編輯出版了10多本書籍，包括《發展社會學》、《蘇聯社會學》、《城市化與城市社會學》、《婚姻家庭與現代社會》、《夫婦沖突》、《心理治療導論》等。
陳奕君教授於1987年再次被派往北美，在加州大學洛杉磯分校專攻婚姻、家庭與社會工作，並於1988年回國後開始從事婚姻家庭研究與咨詢。
20世紀90年代，陳奕君教授先後到美國哈佛大學、美國羅傑斯大學、歐洲哥本哈根大學和聖加侖大學訪問講學，與國際學術界建立了廣泛的聯系。
1993，經綸家庭科學中心成立，並承擔了壹系列國際合作項目。
2000年，由美國福特基金會組織和資助了壹批學者成立了青少年性健康教育信息中心，出版了《青蘋果》雜誌，建立了青蘋果網站、青蘋果健康咨詢熱線和青蘋果家長學校。
2001，人民教育出版社出版了陳奕君教授主編的《青少年性健康教育叢書》，在京、滬、津等教育部門廣泛使用。
2003年8月，衛生部和民政部批準中國性學會成立青少年性健康教育專業委員會，陳奕君任主任。
從社會科學院的專職崗位上退休後，陳奕君教授更加忙碌地在社會舞臺上承擔各種重任。除了年復壹年主持“青蘋果”國際合作項目，她還積極參與許多重大社會活動。此外，她還擔任過NLD中央婦女委員會副主任、中國婚姻家庭研究會常務理事、中國人口文化促進會副秘書長、中國社會工作者協會婚姻家庭專業委員會副會長等職務。她經常被邀請去演講和參加會議。