這個問題問的是不同氨基酸的性質，而不是蛋白質中每個氨基酸的種類和排列順序。
單獨把壹個氨基酸拿出來，它只是壹個化合物，和蛋白質沒有關系。對於化合物來說，不同種類的氨基酸，就像碳酸鈉和碳酸鉀壹樣，只看其結構與化學性質的關系。顯然，影響不同種類氨基酸的化學和物理性質的因素只有R基團，如溶解度、酸堿性、等電點等。即使從它們的分子結構來看，不同種類的氨基酸也只是它們的R基團不同。由於R基團不同，它們之間的物理化學性質也不同。如下圖。
對於某種蛋白質來說，氨基酸的種類和排列順序是由基因決定的。這是對的。體現在蛋白質上，就是蛋白質結構和功能的不同。
如果問氨基酸，只需要考慮氨基酸，不用考慮蛋白質。