1993年，大連新港海產品有限公司（大連棒棰島海產企業集團前身）成立，結束了大連地區沒有工業化海參加工的歷史，大連海參加工業進入了全新的發展時期。
1996年，公司率先註冊“棒棰島”商標，開始了品牌化發展的道路。
2003年，棒棰島海參率先被評為“有機食品”、“綠色食品AA”級，是我國首家海參綠色食品。公司導入ISO9001國際質量管理體系、HACCP體系，全面實施質量跟蹤控制管理。作為主要起草人，參與了《中華人民***和國國家標準—大連海參》等多項標準的制定，為我國海參加工業的規範化發展作出了積極貢獻。
2003年，棒棰島海產企業集團成立，下轄海參發展有限公司、原種科技發展有限公司、海洋生物工程有限公司三家全資子公司。
同年，公司斥巨資建設了海參繁育基地、精深加工基地等兩大基地。
2004年，公司被評為“農業產業化國家重點龍頭企業”。
2004年、2005年，臺灣東森衛視記者兩次對公司進行專題采訪，並在東森衛視播出，反響強烈。
2005年7月，農業部副部長牛盾在視察棒棰島海參基地後，激動地說，棒棰島海參基地建的好，充分顯示了壹個國家級產業化龍頭企業的實力和作用。
2006年5月13日， 由我公司承建、管理的國內唯壹的國家級刺參原種場通過了國家農業部驗收。國家級刺參原種場自2002年開建以來，先後畜養珍稀原種刺參3000多萬頭，為周邊養殖戶提供優良苗種6000多萬頭，體現出了其應有的產業價值和生態效應，凸顯了棒棰島的社會責任感和原種海參資源保護能力。
2006年9月，在遼寧省商務廳舉行的“遼寧市場暢銷自主品牌”評選活動中，棒棰島海參榮譽上榜。
2006年10月，香港《陽光》雜誌總編壹行3人開始了對公司的采訪，並在該雜誌上發表專題新聞報道，擴大了公司和棒棰島海參在香港地區的影響力。
2006年，在統壹品牌戰略下，公司開發的即食海參、遼參膠囊、淡幹海參在市場上獲得了成功。棒棰島海參系列產品邁向全國市場，得到了經銷商和消費者的廣泛認可。
2006年12月，棒棰島海參被國家質檢總局認定為國家地理標誌保護產品，成為大連地區首家通過《國家地理標誌——大連海參》標準的產品。
2007年1月 大連棒棰島海參發展有限公司被列為“農業部工廠化循環水養殖試點場”。
2007年3月，農業部公布全國152家單位獲得農業部水產健康養殖示範區稱號，其中，集團下屬的大連棒棰島海參發展有限公司被列為“農業部工廠化循環水養殖試點場”。
2007年9月，棒棰島海參被國家工商總局評為“中國馳名商標”。
2007年10月，大連西安路百盛專櫃日銷售突破100萬元，開創了業內單店單日百萬元的銷售記錄。
2007年12月，預計全年公司銷售收入可達1.6億元以上，增幅達50%以上。
2008年5月12日四川汶川等地發生8.0級地震。5月13日，公司向四川地震災區捐贈20萬元人民幣，海參膠囊100萬元。
2008年5月15日，公司工會號召全體員工捐款，募集捐款10萬余元。
2008年5月21日，全國《幹海參國家標準》研討會在棒棰島海參基地召開。來自青島、北京、大連的權威專家和學者以及業內主要廠家就幹海參國家標準進行了討論。